270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1438 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 257 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  54.47 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  54.47 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  51.94 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  51.55 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  51.55 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  54.26 
 
 		 256 aa  255  6e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  47.27 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  48 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.97 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  30.89 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  34.04 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  32.65 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  34.67 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  27.75 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  31.09 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  29.2 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  28.19 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  28.75 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  30.17 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  29.1 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  26.34 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  29.58 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  29.49 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  27.63 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  29.55 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  30.28 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.72 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  25.98 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  26.87 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  26.7 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.69 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  25.1 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  30.22 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  26.34 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  24.7 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  26.34 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.94 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  26.27 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.48 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  24.58 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  24.58 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  25.1 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  27.43 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.69 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.69 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  27.69 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  30.51 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  30.38 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  27.85 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  30.38 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  27.85 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  27.2 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  28.23 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  25.57 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  29.25 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.29 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  31.14 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  26.69 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.78 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  26.53 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  25.74 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  26.53 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  26.83 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  26.23 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  24.88 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  28.52 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  24.1 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  26.36 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  27.43 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  25.52 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  27.43 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  25.64 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.52 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  29.11 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  25.52 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0859  type III secretion system inner membrane R protein  27.16 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  26.91 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  27.57 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>