290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0741 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 253 aa  480  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  44 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  42.74 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  38.31 
 
 		 253 aa  171  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  40.59 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  44.94 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0859  type III secretion system inner membrane R protein  43.27 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0960  flagellar biosynthetic protein FliR  45.24 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  34.04 
 
 		 260 aa  118  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  34.45 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  34.65 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  32.9 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  35.37 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  34.54 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  34.54 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  34.54 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  34.47 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  36.02 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  33.74 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  31.72 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  36.14 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  32.77 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  35.89 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  32.48 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.3 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  34.32 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  32.5 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  34.32 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  31.02 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  35.74 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  30.83 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  34.84 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  35.74 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.06 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  36.67 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.61 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  34.68 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  29.31 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  36.25 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  36.25 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.25 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.25 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  36.25 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  36.25 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.31 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  32.89 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  33.05 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  32.46 
 
 		 264 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.12 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  32.46 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  32.46 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  32.46 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  29.6 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  30.67 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  36.25 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  31.49 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  33.92 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.76 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1555  flagellar biosynthesis protein FliR  28.86 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.751445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1765  flagellar biosynthesis protein FliR  28.86 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  30.37 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3610  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.400398  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1591  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  30.19 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1714  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1591  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.311192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1734  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0171793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1788  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1544  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.903592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1843  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0356733  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  32.52 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  30.2 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  30.45 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.51 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  29.6 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  30.56 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0157  putative flagellar biosynthesis pathway protein  28.02 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  33.17 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  28.05 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29.58 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  31.09 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  29.58 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  29.58 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  29.58 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>