271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2260 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 		 239 aa  460  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  32.76 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  35.62 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  31.78 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  31.71 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  33.98 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  28.19 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  35.4 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  33.63 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  30.73 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  31.84 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  33.67 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  30.09 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  31.61 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  29.39 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  29.3 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  33.95 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  31.17 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  35.81 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 261 aa  92  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  28.73 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  27 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  35.1 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  32.2 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  27.86 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  32.32 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  32.04 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  30.7 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  30.48 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.81 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  37.11 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  30.65 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  28.36 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  31.64 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  26.98 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  26.51 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  33.96 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  26.5 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.32 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.82 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  29.78 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  29.41 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  31.11 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  28.93 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  29.76 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  29.94 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  29.87 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  27.95 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  30.32 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  30.72 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  29.81 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  27.88 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  35.24 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  28.04 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.6 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  25.63 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.32 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  29.18 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  29.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  27.94 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  34.45 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  30.06 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  26.13 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.83 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  25.63 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  28.5 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  33 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  32.7 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  26.13 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  32.05 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  25.63 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  25.63 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  29.8 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  34.34 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  26.76 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  32.3 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  25.13 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  25.51 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  25.51 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  25.51 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  25.51 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  29.72 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  29.9 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  28.92 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  29.05 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.14 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>