235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2130 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 		 259 aa  487  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  37.35 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  34.58 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  30.89 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  32.39 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  33.48 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  31.03 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  32.26 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  30.6 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.39 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  31.54 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  27.42 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  27.54 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  30.95 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  32.56 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  27.51 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  28.19 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  29.11 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  26 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  31.47 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  29.67 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  25.43 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  29.89 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  29.79 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  31.15 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  31.16 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  25.73 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  30.93 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  26.46 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  31.12 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  30.09 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  29.89 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  27.12 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  26.01 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  25.93 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  30.51 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  27.69 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  26.56 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  27.69 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  26.29 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  25.1 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  24.18 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  28.12 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  28.19 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  28.95 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  26.02 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.41 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  26.53 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.05 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  25.22 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  27.27 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  22.76 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.09 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  25.51 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  27.04 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  22.5 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  25.32 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  27.68 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  26.15 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  23.98 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  25.22 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  27.04 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  22.08 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  22.73 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  26.82 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  23.4 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  23.4 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  23.4 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  23.4 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  26.82 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  23.17 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  22.98 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  22.31 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  25.81 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  24.29 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.98 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  27.6 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  24.79 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  24.49 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  25.68 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  27.67 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  22.13 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  23.89 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  23.63 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  26.21 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0189  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  31.49 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  23.5 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  25.7 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  24.39 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  23.5 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  26.11 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>