278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1396 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 256 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  93.75 
 
 		 256 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  82.68 
 
 		 256 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  78.35 
 
 		 255 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  79.53 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  79.53 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  77.17 
 
 		 255 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  47.71 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  46.44 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  45.38 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  46.84 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  45.61 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  45.61 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  45.61 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  46.86 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  41.06 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  35.5 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  32.34 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  34.89 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  33.03 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  32.19 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  38.24 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.24 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  33.91 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  31.38 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  31.54 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  30.47 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  30.1 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.7 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  31.78 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  37.14 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  31.33 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  32.22 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  32.34 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  31.78 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  30.13 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  31.31 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  32.79 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  28.1 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.86 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  32.09 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  34.13 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  33.82 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  29.87 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.87 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  29.87 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.88 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  33.79 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.79 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.79 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.46 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  29.39 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  30.56 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  30.13 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  25.46 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  29.11 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  28.21 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  33.9 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  25.61 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  34.1 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  29.11 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  25.61 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  29.11 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  28.87 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.63 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  29.29 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  29.29 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  29.29 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.69 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  26.14 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.73 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  25.83 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  28.34 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  27.88 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  28.99 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  25.78 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  34.25 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  29.69 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  30.96 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  25.2 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  27.9 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  30.36 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>