More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1668 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  49.59 
 
 		 256 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  43.75 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  47.5 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  41.06 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  42.56 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0960  flagellar biosynthetic protein FliR  41.59 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0859  type III secretion system inner membrane R protein  42.67 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  35.96 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  31.1 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  27.67 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  31.96 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  34.42 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  32.39 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  34.26 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  33.8 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  38.67 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  38.67 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  27.94 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  34.58 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  33.8 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.72 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  30.1 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  33.01 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  37.02 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  29.46 
 
 		 253 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  32.19 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  32.19 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  29.68 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  30.9 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  24.89 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.15 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  31.15 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.45 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  33.76 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3900  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.48 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.772614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  28.91 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0157  putative flagellar biosynthesis pathway protein  32.17 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3927  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  31.48 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3812  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  31.48 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  27.23 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  27.2 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  27.7 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  29.82 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  22.68 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  30.64 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  28.12 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  31.66 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  29.58 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1976  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.14 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  26.24 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  27.03 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2280  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  31.14 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102149  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  30.91 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  28.1 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  30.52 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  24.51 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  30.92 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  27.78 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  26.69 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  27.91 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  31.92 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  26.17 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  24.05 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  30.22 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4065  type III secretion system inner membrane R protein  31.93 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  28.4 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01724  Type III secretory pathway, component EscT  31.93 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.29 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  24.17 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.73 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  29.31 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003360  type III secretion protein SpaR  32.53 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  25.64 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  25.99 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0704  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0720093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  28.37 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  28.5 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5073  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.65 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0268532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  28.64 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0241  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306618  normal  0.0171126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  27.68 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  25.68 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  25.84 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  26.25 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>