27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0157 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0157  putative flagellar biosynthesis pathway protein  100 
 
 		 246 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  28.02 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  31.84 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  28.27 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0960  flagellar biosynthetic protein FliR  29.96 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  25.31 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  29.78 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  25.21 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  26.52 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0859  type III secretion system inner membrane R protein  27.42 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  23.95 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  23.96 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  20.85 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  22.67 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  26.44 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  22.03 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  25.55 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  27.97 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  25.55 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  25.21 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  27.14 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  23.87 
 
 		 254 aa  42  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  23.61 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  24.12 
 
 		 254 aa  42  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  28.09 
 
 		 257 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>