298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1653 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 266 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  84.76 
 
 		 269 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  84.76 
 
 		 269 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  43.06 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  35.15 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  42.03 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  39.44 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  36.47 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  34.6 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  36.86 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  36.08 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  35.48 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  36.08 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  38.4 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  35.15 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  34.65 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  35.02 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  34.47 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  35.08 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  34.03 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  34.63 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  34.47 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  34.63 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  34.63 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  34.63 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  34.35 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  34.04 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  35.86 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  37.74 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  34.87 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  33.85 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  34.43 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  33.72 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  36.51 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  33.46 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  33.72 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  32.39 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.75 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  35.15 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  33.96 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  37.96 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  36.62 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  35.71 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  32.63 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.53 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.53 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  32.77 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  31.23 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  31.92 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  35.88 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  38.42 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  35.12 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.93 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.34 
 
 		 256 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  32.48 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  36.07 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  31.3 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  31.25 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  32.03 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  32.34 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  28.29 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  35.18 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  29.73 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.03 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  30.71 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  31.84 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  31.3 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  29.44 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  28.69 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  30.8 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  33.99 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  31.17 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  34.13 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  31.95 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  29.37 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  31.38 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  32.06 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  34.07 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  34.07 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  34.07 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>