290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4424 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
264 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  47.76 
 
 
260 aa  221  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  47.35 
 
 
260 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  38.96 
 
 
259 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  36.55 
 
 
259 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  41.46 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  36.55 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  39.76 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  38.96 
 
 
261 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.53 
 
 
258 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  38.06 
 
 
258 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0704  flagellar biosynthetic protein FliR  42.86 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0720093  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0241  flagellar biosynthetic protein FliR  42.26 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306618  normal  0.0171126 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.4 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0165  flagellar biosynthetic protein FliR, putative  39.51 
 
 
258 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0214  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  40.51 
 
 
258 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0624  flagellar biosynthetic protein FliR  41.6 
 
 
257 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  40.09 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4646  flagellar biosynthetic protein FliR  41.22 
 
 
265 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  0.627037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  36.03 
 
 
258 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  37.65 
 
 
258 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  37.65 
 
 
258 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  36.4 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  36.84 
 
 
258 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  39.15 
 
 
258 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  38.06 
 
 
261 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  34.62 
 
 
261 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.82 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  38.46 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  39.22 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  32.34 
 
 
259 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  34.53 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.34 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  35.09 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  38.46 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.24 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  31.98 
 
 
260 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.76 
 
 
247 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  32.91 
 
 
247 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.56 
 
 
261 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 
261 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 
261 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  33.97 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  33.88 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.88 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.88 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  31.5 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  33.63 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  31.66 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  32.46 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  34.96 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  35.37 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  31.86 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  33.73 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  31.86 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  31.86 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  34.35 
 
 
260 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 
265 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  35.02 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 
260 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  36.64 
 
 
260 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  34.07 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  35.85 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  31.01 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  34.33 
 
 
264 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.88 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  30.13 
 
 
265 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  30.97 
 
 
262 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 
240 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  33.04 
 
 
260 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  33.64 
 
 
257 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  33.64 
 
 
257 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  31.84 
 
 
260 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 
260 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  32.64 
 
 
256 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  33.61 
 
 
260 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  33.61 
 
 
260 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.86 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.86 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  29.02 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  32.88 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  32.27 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>