264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4065 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4065  type III secretion system inner membrane R protein  100 
 
 
334 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  27.89 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  27.68 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
255 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.61 
 
 
260 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  33.89 
 
 
261 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  33.71 
 
 
264 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  27.44 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  31.46 
 
 
255 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  34.73 
 
 
263 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.93 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.99 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  32.18 
 
 
263 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  31.61 
 
 
259 aa  86.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  32.3 
 
 
252 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.87 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.22 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  30.81 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  32.45 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.38 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5073  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  26.46 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0268532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  29.94 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  33.11 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  28.44 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  33.69 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  30.91 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  33.11 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  31.15 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  30.05 
 
 
259 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  30.52 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  28.31 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  32.1 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  26.19 
 
 
240 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  29.83 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  25.82 
 
 
254 aa  77  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  22.74 
 
 
264 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  26.39 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  30.13 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  26.56 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  28.89 
 
 
257 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0960  flagellar biosynthetic protein FliR  31.76 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  26.63 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  29.01 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  31.84 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  28.64 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  24.38 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  30.34 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  31.74 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  24.55 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  23.91 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  28.25 
 
 
258 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  31.17 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  28.12 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  25.53 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.77 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  28.3 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  29.41 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  29.8 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  26.11 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  22.83 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  22.83 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  22.83 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0872  Hrp conserved HRCT transmembrane protein  30.81 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224699  hitchhiker  0.00958817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  29.59 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  28.99 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  29.56 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  27.36 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  25.62 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  28.02 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  28.02 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1517  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.84 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0297433  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  28.26 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  29.47 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  26.86 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1554  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.84 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1531  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.84 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1753  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.27 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334723  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  26.62 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4646  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  0.627037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1922  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  27.27 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.87 
 
 
264 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  26.92 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  28.22 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  28.34 
 
 
258 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  28.8 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  26.92 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>