268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3035 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
259 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  75.79 
 
 
259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  51.76 
 
 
260 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  48.8 
 
 
265 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  48.8 
 
 
265 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  48.8 
 
 
265 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  46.83 
 
 
267 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  48 
 
 
265 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  48 
 
 
265 aa  244  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  47.2 
 
 
265 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  47.2 
 
 
265 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  47.2 
 
 
265 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  47.2 
 
 
265 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  46.03 
 
 
267 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  43.41 
 
 
260 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  44.4 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  43.41 
 
 
260 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  43.41 
 
 
260 aa  229  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  45.22 
 
 
265 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  45 
 
 
262 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  44.49 
 
 
266 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  44.02 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  44.17 
 
 
261 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  47.13 
 
 
261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  42.69 
 
 
258 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  40.62 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  40.96 
 
 
258 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  42.97 
 
 
258 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  42.58 
 
 
258 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  39.58 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  38.55 
 
 
258 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  38.96 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  40.97 
 
 
257 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  39.76 
 
 
258 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  40.51 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  38.55 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  39.26 
 
 
258 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  37.04 
 
 
247 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  38.96 
 
 
256 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  40.27 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  38.53 
 
 
256 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  38.64 
 
 
260 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.72 
 
 
258 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  34.51 
 
 
263 aa  158  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.72 
 
 
258 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  38.12 
 
 
253 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  41.4 
 
 
236 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  33.73 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  38.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  37.65 
 
 
259 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  32.94 
 
 
259 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  32.55 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  32.43 
 
 
264 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  35.94 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  32.59 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  33.6 
 
 
256 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  32.1 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.16 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.69 
 
 
261 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  34.82 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  36.33 
 
 
259 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.24 
 
 
261 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 
261 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 
260 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
240 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 
260 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 
260 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 
247 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.47 
 
 
256 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  32.22 
 
 
257 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  33.93 
 
 
260 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  33.76 
 
 
260 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  37.75 
 
 
266 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  32.22 
 
 
257 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
247 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  34.06 
 
 
260 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  32.78 
 
 
261 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  31.06 
 
 
260 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 
256 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  34.84 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  28.92 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  31.06 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0214  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  32.14 
 
 
258 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  30.38 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  30.38 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  34.31 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  29.71 
 
 
269 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.71 
 
 
269 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1868  flagellar biosynthetic protein FliR  35.24 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.719661 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4646  flagellar biosynthetic protein FliR  35.58 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  0.627037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.19 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  30.9 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  29.28 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  27.95 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.07 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  31.36 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.36 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.36 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>