279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02875 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  75.79 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  53.52 
 
 		 260 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  49.03 
 
 		 265 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  49.03 
 
 		 265 aa  252  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  49.03 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  48.64 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  48.25 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  46.69 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  47.06 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  47.06 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  47.08 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  47.06 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  46.67 
 
 		 265 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  43.97 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  43.8 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  44.36 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  41.86 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  44.13 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  41.47 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  43.19 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  43.63 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  41.9 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  44.16 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  40.32 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  41.11 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  41.8 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  41.41 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  37.75 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  37.01 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  37.4 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  36.55 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  39.11 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  37.4 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  37.89 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  36.51 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  36.58 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  41.47 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  39.37 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  36.51 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  42.79 
 
 		 236 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.6 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  37.21 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  36.82 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  33.89 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  34.3 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  35.54 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  33.9 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  35.06 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  34.38 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  35.04 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  34.32 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  37.71 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  36.86 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  32.94 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  32.22 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  35.34 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.02 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  35.53 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  37.26 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  35.59 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  32.5 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  35.06 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  38.28 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  31.95 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.95 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.95 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  36.79 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  35.12 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  34.39 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  31.76 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  38.68 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  38.21 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  38.21 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  38.21 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  38.21 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  34.31 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  34.57 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  31.38 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  34.57 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  31.34 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  31.08 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  29.28 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.28 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  34.33 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  33.66 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  33.66 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  34.15 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  35.94 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>