299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1513 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 258 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  92.25 
 
 		 258 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  97.67 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  96.51 
 
 		 258 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  73.26 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  67.44 
 
 		 261 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  69.38 
 
 		 258 aa  348  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  69.38 
 
 		 258 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  65.5 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  66.28 
 
 		 258 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  49.8 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  42.25 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  44.9 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  44.9 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  39.13 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  40.16 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  44.49 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  48.92 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  44.08 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  45.19 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  44.08 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  44.08 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  44.08 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  41.7 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  43.67 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  42.56 
 
 		 260 aa  197  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  40.66 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  43.97 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  41.73 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  41.28 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  41.63 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  39.13 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  42.79 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  41.18 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  41.78 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  40.23 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  40.98 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  41.89 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  38.74 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  40.66 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  37.2 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  36.36 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  41.95 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  45.45 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  37.4 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  39.15 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  38 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.3 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.55 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  38.22 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  35.41 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  38.58 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  36.76 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  36.07 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  36.07 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  40.66 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  38.19 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  38.74 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  40.09 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  37.25 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  36.12 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  38.37 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  36.96 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  34.63 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  37.44 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  31.78 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  37.65 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  43.42 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  43.42 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  42.98 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  43.42 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  43.42 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  42.36 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  33.59 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  36.12 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  36.12 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  36.12 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  40.47 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  37.65 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  42.42 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  39.6 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  39.6 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  34.91 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  42.42 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  42.42 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  41.99 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  41.99 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  41.99 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  38.86 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  38.86 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  36.56 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  37.44 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  36.56 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.56 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.56 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  36.56 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  36.56 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>