More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4763 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4763  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0065  inner-membrane translocator  97.25 
 
 		 291 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  80.76 
 
 		 291 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1816  inner-membrane translocator  79.73 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4090  branched chain amino acid ABC transporter permease  79.09 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00306357  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0483  inner-membrane translocator  65.98 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1320  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3807  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  28.81 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.03 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  25.9 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  26.4 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.01 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.01 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  25.93 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.01 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  26.33 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  25.67 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  26.23 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  24.66 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.17 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  26.01 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  25.83 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  25.67 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 289 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  25.34 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.04 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 309 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.55 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.04 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  26.3 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  27.87 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3907  inner-membrane translocator  26.3 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  24.67 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 652 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  24.67 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  24.67 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.24 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  26.37 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  25 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.42 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 338 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4442  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 309 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  26.21 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  26.86 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5095  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00123813  normal  0.0753948 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  26.86 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  26.51 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  24.42 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  24.33 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  25.82 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  27.54 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  24.57 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  26.13 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  24.67 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>