More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0065 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0065  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4763  inner-membrane translocator  97.25 
 
 		 291 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  80.76 
 
 		 291 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1816  inner-membrane translocator  80.07 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4090  branched chain amino acid ABC transporter permease  79.44 
 
 		 291 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00306357  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0483  inner-membrane translocator  66.67 
 
 		 291 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1320  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3807  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  29.59 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.97 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  26.16 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.36 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  26.23 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  26.01 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 316 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  28.04 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  26.23 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 338 aa  99.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  25.67 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  26.96 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  25.67 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.92 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  26.35 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.92 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.92 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.3 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  24.74 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.36 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  27.12 
 
 		 335 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3907  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  25.41 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  27.56 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  25.09 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  25 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  25 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  25 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.8 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 309 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  26.03 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  25.72 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  25.72 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  25.72 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  25 
 
 		 304 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.16 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  25.64 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  26.91 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.16 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  25.16 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.16 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.55 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  25.4 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  25.4 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  25.4 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.82 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 338 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.08 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.34 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  25 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>