More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1320 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1320  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0065  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4763  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0483  inner-membrane translocator  37 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1816  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4090  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.07 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00306357  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3807  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.94 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.3 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.3 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.3 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3907  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2176  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.817413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  28 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2529  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.658317  normal  0.422906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  27.62 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  27.1 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  27.24 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.63 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.91 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  24.65 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  31.05 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.07 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0053  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.33 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.57 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  25.69 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 548 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  25.64 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01986  amino-acid transmembrane lipoprotein ABC transporter  29.62 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.230121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  26.03 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  29.18 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.36 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  26.94 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  26.91 
 
 		 542 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  27.62 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  27.62 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.94 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  25.17 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  26.58 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.8 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.48 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  27.16 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1944  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 642 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  26.58 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  24.52 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0300  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  29.83 
 
 		 642 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247535  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 603 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  25.55 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>