More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1816 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1816  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1940  inner-membrane translocator  80.76 
 
 		 291 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0065  inner-membrane translocator  80.07 
 
 		 291 aa  434  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4763  inner-membrane translocator  79.73 
 
 		 291 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4090  branched chain amino acid ABC transporter permease  76.63 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00306357  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0483  inner-membrane translocator  64.95 
 
 		 291 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1320  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3807  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 325 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  25.93 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  28.9 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2031  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.98 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  26.26 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.3 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  26.82 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.19 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.12 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  27.55 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.38 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.55 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.61 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.55 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  27.61 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  26.82 
 
 		 338 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.55 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  26.16 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 319 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 319 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.81 
 
 		 319 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  25.34 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.33 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50530  branched-chain amino acid transport protein BraD  29.59 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  26.21 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  26.33 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  26.9 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4304  branched-chain amino acid transport protein BraD  29.25 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.77 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3739  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.97 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.61 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3907  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  25.32 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3794  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.192822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  26.82 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  27.01 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  26.82 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0258  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0259  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.63 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3860  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.76 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3865  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.63 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>