104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2767 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2767  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.462826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  95.83 
 
 
247 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  95.83 
 
 
247 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.53 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.53 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.53 
 
 
273 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  52.05 
 
 
247 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.16 
 
 
273 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.16 
 
 
273 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.16 
 
 
273 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.77 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.16 
 
 
279 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 
246 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
241 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.54 
 
 
260 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40900  putative short-chain dehydrogenase  58.93 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.54 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
271 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
260 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.32 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
247 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.67 
 
 
253 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19061  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.67 
 
 
253 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.67 
 
 
253 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22566  normal  0.805901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
248 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
260 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000133736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
257 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  62.16 
 
 
274 aa  43.9  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  50 
 
 
284 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
266 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.28 
 
 
247 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1002  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
253 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
254 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.33 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.44 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
299 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
239 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
254 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  47.46 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 
252 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3469  putative short-chain dehydrogenase  50 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
254 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 
276 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
250 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
238 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
661 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
262 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0423  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.21 
 
 
242 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
245 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
256 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36 
 
 
256 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.61 
 
 
248 aa  41.2  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000194485  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.53 
 
 
257 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
244 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.41 
 
 
253 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0599509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
244 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
239 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
234 aa  40.8  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
234 aa  40.8  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.71 
 
 
252 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
264 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
242 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
248 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
253 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
253 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
244 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
248 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
248 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
252 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  52.94 
 
 
262 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
258 aa  40.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0338  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.94 
 
 
241 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
260 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.41 
 
 
253 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
268 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.62 
 
 
277 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
272 aa  40.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  35.38 
 
 
234 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
267 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.35 
 
 
267 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  38.33 
 
 
258 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  38.33 
 
 
258 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
287 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
254 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
236 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.433499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
253 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
272 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
292 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
249 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>