186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0897 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0897  integrase family protein  100 
 
 		 553 aa  1125    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  40.78 
 
 		 481 aa  133  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  29.56 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  36.06 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 432 aa  91.3  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5756  integrase family protein  36 
 
 		 422 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.6 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2501  phage integrase, putative  28.5 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  27.33 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.36 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.88 
 
 		 414 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.44 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  32.09 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  24.64 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.67 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.07 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  26.94 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  24.33 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  26.69 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  24.67 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.86 
 
 		 437 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  24.33 
 
 		 422 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.69 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.69 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  25.54 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.6 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  22.74 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.37 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  26.91 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.51 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  23.67 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.52 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.98 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  22.82 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  24.34 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.86 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  28.69 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25.94 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  22.38 
 
 		 411 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.76 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  22.81 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  32.71 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.55 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  26.49 
 
 		 399 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  22.34 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  23.1 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  25.08 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  30.65 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  32.84 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  23.1 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  26.45 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  22.34 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  22.86 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.51 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  26.62 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.57 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  22.55 
 
 		 449 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 425 aa  57  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.54 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  22.34 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  21.82 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  19.64 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  24.42 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  27.94 
 
 		 602 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 414 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.38 
 
 		 388 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  23.71 
 
 		 418 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  21.45 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  26.2 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  24.34 
 
 		 411 aa  55.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  22.5 
 
 		 402 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  25.83 
 
 		 390 aa  54.7  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 396 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  26.27 
 
 		 419 aa  54.3  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  23.47 
 
 		 417 aa  53.9  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  28.87 
 
 		 418 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  28.57 
 
 		 417 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  30.61 
 
 		 415 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  23.1 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  26.27 
 
 		 419 aa  53.9  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  21.92 
 
 		 415 aa  53.9  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.37 
 
 		 414 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  25 
 
 		 404 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  23.1 
 
 		 394 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.71 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  26.32 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.28 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>