213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5756 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5756  integrase family protein  100 
 
 		 422 aa  865    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  41.54 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2501  phage integrase, putative  32.53 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  30.6 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  30.4 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0897  integrase family protein  36 
 
 		 553 aa  88.2  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  28.14 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.77 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.53 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.48 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  28.52 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  28.03 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.78 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.35 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  28.86 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.69 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.97 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  32.24 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  24.37 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  23.57 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  24.37 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  23.01 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  24.7 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  26.12 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  26.12 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  30.65 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  24.05 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  28.85 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  30.85 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.05 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.57 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  29.61 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.37 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  23.36 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  25.83 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.6 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  25 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  30.94 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  25.28 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  30.77 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.77 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.22 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  23.08 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  21.27 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  24.38 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  28.37 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.66 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  29.38 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  25.18 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  30 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.59 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.71 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  23.56 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  27.56 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  28.73 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  29.67 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  24.28 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  25 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  27.44 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  22.27 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  27.6 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  24.35 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  30.77 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  26.06 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  22.22 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  24.19 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  24.47 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  23.97 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  31.28 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  27.04 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  26.23 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  26.01 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  25.58 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  25 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  23.83 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  30.61 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  22.7 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  22.63 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  24.05 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  28.04 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>