More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1543 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  100 
 
 		 477 aa  929    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  56.24 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  55.46 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  54.11 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  52.74 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  51.27 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  53.67 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  51.58 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  52.84 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  51.69 
 
 		 488 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  46.09 
 
 		 495 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  44.7 
 
 		 467 aa  292  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  40.91 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  42.14 
 
 		 470 aa  279  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  44.82 
 
 		 495 aa  276  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  40.13 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  39.69 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  44.93 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  48.43 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  44.15 
 
 		 489 aa  266  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  41.13 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  42.89 
 
 		 473 aa  260  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  38.66 
 
 		 477 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  39.34 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  41.67 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  43.31 
 
 		 474 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.21 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  39.83 
 
 		 483 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  40.34 
 
 		 475 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  37.76 
 
 		 488 aa  240  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  40.66 
 
 		 483 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  38.05 
 
 		 475 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  39.56 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  38.51 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  39.63 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  37.66 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  39.06 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.29 
 
 		 484 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  41.88 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  40.33 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  40.33 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  40.33 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  38.05 
 
 		 476 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  38.75 
 
 		 474 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  40.59 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  37.67 
 
 		 519 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  39.83 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  38.43 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  38.74 
 
 		 495 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  40.17 
 
 		 482 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  37.33 
 
 		 495 aa  223  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  36.13 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  37.95 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  38.33 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  34.81 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  39.03 
 
 		 475 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.33 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  37.5 
 
 		 474 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.5 
 
 		 472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.27 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.12 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.55 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  35.85 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  39.27 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.22 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  38.62 
 
 		 490 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.73 
 
 		 501 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  37.34 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  35.89 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  36.72 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  37.86 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  42.95 
 
 		 484 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  34.36 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  36.5 
 
 		 503 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  38.1 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.29 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  43.99 
 
 		 485 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.81 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  40.04 
 
 		 498 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  37.25 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  38.17 
 
 		 522 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  35.52 
 
 		 487 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3429  Amidase  41.74 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  37.19 
 
 		 472 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  35.43 
 
 		 492 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.35 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  37.65 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  35.76 
 
 		 496 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  36.97 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  36.57 
 
 		 481 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  35.64 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.18 
 
 		 485 aa  199  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  34.32 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  36.9 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  34.17 
 
 		 491 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  34.99 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  40.68 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  40.39 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.8 
 
 		 493 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  34.56 
 
 		 494 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>