More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3429 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3429  Amidase  100 
 
 		 457 aa  861    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  44.83 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  46.67 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  45.74 
 
 		 485 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  43.98 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3824  amidase  42.62 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315125  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  43.12 
 
 		 476 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  34.47 
 
 		 503 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.91 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2712  amidase  41.86 
 
 		 504 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.917401  normal  0.488259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  36.34 
 
 		 465 aa  220  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  36.05 
 
 		 467 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12389  amidase  41.87 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  35.84 
 
 		 467 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  41.97 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  37.05 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  42.17 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  40.76 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  40.76 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  40.76 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  43.58 
 
 		 472 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  36.76 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  35.61 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  38.03 
 
 		 477 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  39.7 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  36.52 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  38.94 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  39.91 
 
 		 476 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  39.17 
 
 		 476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  33.96 
 
 		 488 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  36.17 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  43.18 
 
 		 469 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  35.55 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  36.64 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  35.64 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  36.08 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  39.5 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  36.29 
 
 		 493 aa  189  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  38.55 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  37.32 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  36.27 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.48 
 
 		 499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  33.4 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  36.88 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0864  amidase  40.4 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241071  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0781  putative amidase  41.24 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  38.81 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  37.26 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  35.5 
 
 		 509 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2037  Amidase  41.28 
 
 		 470 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.3 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.21 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.05 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.16 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.3 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.78 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  38.64 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  36.24 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  37.08 
 
 		 489 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.2 
 
 		 473 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.52 
 
 		 473 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  32.43 
 
 		 497 aa  176  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  37.99 
 
 		 490 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  34.12 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.7 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  34.25 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  32.21 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  35.12 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  39.3 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.98 
 
 		 495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  33.61 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  38.62 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  34.85 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  35.59 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  35.46 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  37.11 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  37.92 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  35.86 
 
 		 495 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.21 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  34.73 
 
 		 482 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  35.31 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1505  Amidase  39.56 
 
 		 461 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.57 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  34.82 
 
 		 492 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.23 
 
 		 485 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.76 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  37.68 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  34.25 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  34.77 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3751  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.44 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.69 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.93 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.39 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.08 
 
 		 486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  33.87 
 
 		 508 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.75 
 
 		 498 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.4 
 
 		 496 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.38 
 
 		 463 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  34.63 
 
 		 494 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  37.47 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>