More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2712 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12389  amidase  74.01 
 
 		 484 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2712  amidase  100 
 
 		 504 aa  996    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.917401  normal  0.488259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  78.67 
 
 		 504 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  78.67 
 
 		 504 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  78.67 
 
 		 504 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3824  amidase  84.89 
 
 		 505 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315125  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  56.92 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  53.66 
 
 		 484 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  52.88 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  53.41 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  45.27 
 
 		 462 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  39.96 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  36.04 
 
 		 467 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  35.78 
 
 		 467 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  36.66 
 
 		 465 aa  192  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  33.81 
 
 		 534 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3429  Amidase  41.47 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  38.49 
 
 		 476 aa  187  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  37.58 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  37.72 
 
 		 469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0781  putative amidase  39.78 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  37.35 
 
 		 475 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.01 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  34.5 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.97 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0864  amidase  38.89 
 
 		 466 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241071  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  34.32 
 
 		 463 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.83 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.8 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  32.06 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  33.26 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  34.22 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  36.07 
 
 		 477 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.15 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.67 
 
 		 475 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.05 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  33.26 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  34.03 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.14 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.23 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  36.91 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.94 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1505  Amidase  38.86 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  34.36 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2037  Amidase  39.61 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.47 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.21 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  37.94 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.81 
 
 		 491 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.17 
 
 		 485 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.07 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  37.7 
 
 		 489 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  37.7 
 
 		 489 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.26 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  33.91 
 
 		 473 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  37.89 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  34.11 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.13 
 
 		 480 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.14 
 
 		 495 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  37.66 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  34.24 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.4 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.47 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  38.53 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  37.58 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  31.72 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  34.13 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.47 
 
 		 475 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  34.17 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.71 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.35 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.15 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  34 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.76 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.62 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  38.2 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  38.22 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  36.93 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  31.12 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.29 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  35.39 
 
 		 483 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  35.86 
 
 		 472 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0688  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.2 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  33.47 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.89 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.59 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  33.13 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  37.89 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  31.6 
 
 		 501 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.49 
 
 		 496 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  35.74 
 
 		 469 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  33.55 
 
 		 474 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.16 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  32.14 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.41 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  33.4 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  34.07 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  33.62 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  31.92 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  35.6 
 
 		 489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>