More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5815 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  100 
 
 
476 aa  931    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  46.46 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  44.1 
 
 
475 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  42.7 
 
 
474 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  45.51 
 
 
476 aa  293  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  43.97 
 
 
493 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  42.58 
 
 
476 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  46.11 
 
 
486 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  41.86 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  42.4 
 
 
475 aa  283  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  42.62 
 
 
476 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  45.13 
 
 
477 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  40.76 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  44.4 
 
 
471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  37.34 
 
 
488 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  41.42 
 
 
474 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  41.86 
 
 
467 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  41.65 
 
 
495 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  42.36 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  40.6 
 
 
467 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  40.38 
 
 
481 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  42.8 
 
 
474 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  39.35 
 
 
476 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  40.6 
 
 
467 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  41.51 
 
 
483 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  46.05 
 
 
488 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  39.19 
 
 
483 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  43.51 
 
 
476 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  40.9 
 
 
484 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  40.9 
 
 
491 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  38.65 
 
 
501 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  39.49 
 
 
482 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  41.38 
 
 
499 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  39.42 
 
 
508 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.53 
 
 
473 aa  256  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  41.65 
 
 
495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  36.45 
 
 
503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  41.19 
 
 
500 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  39.83 
 
 
480 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  39.83 
 
 
480 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  39.83 
 
 
480 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.74 
 
 
498 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40 
 
 
472 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  41.86 
 
 
495 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  40.82 
 
 
502 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  36.06 
 
 
519 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  38.4 
 
 
476 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.96 
 
 
493 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  38.06 
 
 
470 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  38.29 
 
 
499 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.48 
 
 
501 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.75 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.18 
 
 
531 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  38.71 
 
 
489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  39.3 
 
 
509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  37.19 
 
 
476 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  41.98 
 
 
484 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  39.01 
 
 
479 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  40.43 
 
 
495 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  42.63 
 
 
488 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  40.04 
 
 
493 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  38.33 
 
 
481 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  40.3 
 
 
470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.34 
 
 
485 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  41.91 
 
 
485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  39.09 
 
 
489 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.38 
 
 
472 aa  223  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.8 
 
 
495 aa  223  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  36.27 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  39.09 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  39.09 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  40.12 
 
 
490 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  35.91 
 
 
472 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  45.95 
 
 
480 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  36.63 
 
 
502 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  41.44 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  38.1 
 
 
492 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  41.44 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  37.63 
 
 
489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  41.44 
 
 
489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  38.14 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  38.59 
 
 
492 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  40.51 
 
 
462 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  37.11 
 
 
469 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.47 
 
 
489 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0232  Amidase  42.71 
 
 
472 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.12 
 
 
485 aa  206  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.58 
 
 
496 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  39.34 
 
 
499 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  37.58 
 
 
474 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.6 
 
 
496 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.96 
 
 
473 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  38.04 
 
 
473 aa  204  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  36.03 
 
 
503 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  36.75 
 
 
517 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.84 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.84 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  36.82 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  35.67 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.84 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>