More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2207 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2207  amidase  100 
 
 		 476 aa  941    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  59.58 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  56.51 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  56 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  58.32 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  55.23 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  51.99 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  53.46 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  48.11 
 
 		 488 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  48.42 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  50.85 
 
 		 480 aa  316  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  42.59 
 
 		 465 aa  293  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  43.03 
 
 		 495 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  43.8 
 
 		 495 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  41.61 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  41.61 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  42.09 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  41.25 
 
 		 470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  43.09 
 
 		 476 aa  262  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  42.19 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  41.54 
 
 		 469 aa  257  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  41.08 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  40.5 
 
 		 473 aa  236  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  39.74 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  36.48 
 
 		 477 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  39.23 
 
 		 466 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  36.46 
 
 		 480 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  41.03 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  43.34 
 
 		 501 aa  222  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.87 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  35.05 
 
 		 476 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  35.25 
 
 		 519 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  36.56 
 
 		 469 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  36.08 
 
 		 472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  38.76 
 
 		 480 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  38.76 
 
 		 480 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  36.79 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  38.76 
 
 		 480 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  34.81 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  36.8 
 
 		 508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  34.85 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  37.76 
 
 		 491 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  35.46 
 
 		 474 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  36.07 
 
 		 476 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  41.18 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  37.6 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  35.56 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  40.09 
 
 		 489 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.98 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  36.29 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  40.46 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  36.15 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.87 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.89 
 
 		 495 aa  207  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  39.34 
 
 		 490 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  33.6 
 
 		 503 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.72 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  34.29 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  38.92 
 
 		 489 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  38.92 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  38.92 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  35.8 
 
 		 499 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  36.93 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  35.05 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  35.56 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.01 
 
 		 531 aa  200  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  40.79 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  39.29 
 
 		 500 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  38.52 
 
 		 495 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  33.13 
 
 		 494 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  33.06 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  32.98 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  32.79 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  36.53 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  36.17 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  37.45 
 
 		 482 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  35.07 
 
 		 466 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  32.92 
 
 		 494 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  38.32 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.29 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  34.82 
 
 		 481 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3824  amidase  38.58 
 
 		 505 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315125  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.21 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  35.08 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  35.96 
 
 		 473 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.52 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  37.42 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.31 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.91 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  42.83 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  31.66 
 
 		 470 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  31.95 
 
 		 475 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  36.73 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.26 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.26 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.26 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  36.98 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  34.1 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  35.21 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  34.3 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>