More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3669 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  100 
 
 
480 aa  921    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  53.72 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  54.03 
 
 
489 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  50.97 
 
 
475 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  51.8 
 
 
470 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  50.75 
 
 
476 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  49.46 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  47.74 
 
 
477 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  46.4 
 
 
486 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  48.21 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  47.39 
 
 
488 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  50.26 
 
 
488 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  40.3 
 
 
467 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  39.7 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  41.27 
 
 
495 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  38.76 
 
 
465 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  40.04 
 
 
467 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  38.87 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  36.03 
 
 
503 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  40.76 
 
 
475 aa  232  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  39.38 
 
 
470 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  42.92 
 
 
489 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  36.07 
 
 
488 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  43.63 
 
 
489 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  43.63 
 
 
489 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  41.21 
 
 
474 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  42.64 
 
 
476 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.92 
 
 
493 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  39.96 
 
 
483 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  40.86 
 
 
499 aa  226  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  36.18 
 
 
519 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  39.22 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  39.79 
 
 
472 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  37.45 
 
 
474 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  39.32 
 
 
490 aa  220  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  41.75 
 
 
489 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  41.31 
 
 
495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  42.64 
 
 
471 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.87 
 
 
501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.29 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  38.87 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  37.61 
 
 
474 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  38.2 
 
 
476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  36.23 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  37.6 
 
 
481 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  37.71 
 
 
503 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  39.17 
 
 
492 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  37.87 
 
 
482 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  39.03 
 
 
493 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  38.97 
 
 
492 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  40.89 
 
 
502 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.78 
 
 
498 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.67 
 
 
476 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  34.86 
 
 
501 aa  203  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  39.49 
 
 
509 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  33.61 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.24 
 
 
531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  37.1 
 
 
508 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.04 
 
 
492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  34.99 
 
 
472 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  36.98 
 
 
476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  36.63 
 
 
480 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  36.63 
 
 
480 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  36.63 
 
 
480 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  35.59 
 
 
481 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  37.07 
 
 
493 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  37.04 
 
 
495 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.25 
 
 
496 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.34 
 
 
485 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  38.77 
 
 
492 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34.16 
 
 
475 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  36.86 
 
 
491 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  39.96 
 
 
484 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  32.13 
 
 
479 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.8 
 
 
502 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  41.06 
 
 
485 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  36.65 
 
 
484 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  34.04 
 
 
472 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.78 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  35.57 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  37.1 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  36.31 
 
 
517 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.31 
 
 
496 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.7 
 
 
477 aa  183  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  34.65 
 
 
506 aa  183  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.67 
 
 
494 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.67 
 
 
494 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.67 
 
 
494 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  36.58 
 
 
500 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.81 
 
 
473 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  33.19 
 
 
491 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  37.15 
 
 
495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  36.31 
 
 
521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01110  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.6 
 
 
502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  36.93 
 
 
502 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  38.1 
 
 
466 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  38.23 
 
 
489 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  38.7 
 
 
492 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.49 
 
 
473 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  39.1 
 
 
476 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>