More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  100 
 
 		 493 aa  986    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  73.63 
 
 		 493 aa  631  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  56.94 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  56.94 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  56.94 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  56.97 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  58.01 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  56.01 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  52.34 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  52.67 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  51.31 
 
 		 499 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  54.1 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  47.88 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  49.18 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  46.8 
 
 		 519 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  42.37 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  46.34 
 
 		 508 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  44.33 
 
 		 474 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  44.85 
 
 		 474 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  43.93 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  42.6 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  47.5 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  46.84 
 
 		 500 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.73 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  45.2 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.89 
 
 		 496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  45.2 
 
 		 517 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.89 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.89 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.89 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  43.36 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  45.2 
 
 		 521 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  44.96 
 
 		 499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  46.51 
 
 		 495 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  45.31 
 
 		 502 aa  302  9e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  40.91 
 
 		 488 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  43.87 
 
 		 492 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  43.08 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  41.81 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  40.97 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  42.34 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  39.52 
 
 		 476 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  41.62 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  41.98 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  39.6 
 
 		 531 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  39.83 
 
 		 488 aa  290  6e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  40.69 
 
 		 497 aa  286  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  40.32 
 
 		 476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  43.63 
 
 		 492 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  40.73 
 
 		 522 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  40.4 
 
 		 482 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.92 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  40.08 
 
 		 483 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  43.82 
 
 		 492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  44.02 
 
 		 492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  43.82 
 
 		 492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  38.68 
 
 		 476 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  40.08 
 
 		 473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  37.42 
 
 		 486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  38.24 
 
 		 491 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  41.28 
 
 		 492 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  38.98 
 
 		 480 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  38.98 
 
 		 480 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  38.98 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  38.24 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  41.57 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  41.67 
 
 		 504 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.2 
 
 		 498 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  41.24 
 
 		 481 aa  263  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  43.03 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.76 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  38.72 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  40.94 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  41.09 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  36.55 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  38.21 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  36.81 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  37.55 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  41.46 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  39.28 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  36.65 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  40.04 
 
 		 476 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  35.08 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  40.33 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  35.64 
 
 		 465 aa  229  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  39.8 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  37.68 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  40.08 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  37.68 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  40.08 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  39.26 
 
 		 468 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  40.08 
 
 		 489 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  34.62 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  40.16 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  37.47 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  37.6 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  39.51 
 
 		 476 aa  224  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.65 
 
 		 473 aa  222  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  35.76 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  35.56 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>