More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0280 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0280  Amidase  100 
 
 
469 aa  934    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  77.4 
 
 
470 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  44.62 
 
 
495 aa  315  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  43.23 
 
 
495 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  42.24 
 
 
476 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  40.25 
 
 
470 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  40.92 
 
 
477 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  40.92 
 
 
476 aa  246  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  40.46 
 
 
486 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  39.67 
 
 
476 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  38.25 
 
 
475 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01110  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.5 
 
 
502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  41.54 
 
 
488 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  40.17 
 
 
488 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  37.14 
 
 
477 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  36.59 
 
 
466 aa  206  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  34.02 
 
 
477 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.28 
 
 
489 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  35.31 
 
 
467 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  38.41 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  35.1 
 
 
467 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  34.44 
 
 
465 aa  193  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  34 
 
 
475 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  34.99 
 
 
475 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.5 
 
 
458 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  32.23 
 
 
470 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  35.52 
 
 
466 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  32.24 
 
 
491 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.92 
 
 
472 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  31.84 
 
 
494 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.98 
 
 
463 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  36.05 
 
 
468 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  31.49 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  31.61 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  31.67 
 
 
469 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.76 
 
 
475 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.34 
 
 
484 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  32.71 
 
 
472 aa  170  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  32.7 
 
 
467 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  31.96 
 
 
474 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.26 
 
 
469 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  31.74 
 
 
479 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.67 
 
 
473 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  34.31 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  35.88 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.94 
 
 
501 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0518  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.97 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1650  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.97 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  35.26 
 
 
476 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  31.41 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  45.04 
 
 
499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  31.74 
 
 
531 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.48 
 
 
485 aa  163  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  35.74 
 
 
493 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.69 
 
 
491 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  36.05 
 
 
489 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0864  amidase  37.39 
 
 
466 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241071  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.88 
 
 
484 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.88 
 
 
484 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  34.48 
 
 
490 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  34.1 
 
 
507 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  29.53 
 
 
496 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  30.35 
 
 
481 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  33.75 
 
 
507 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  37.66 
 
 
469 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  33.75 
 
 
498 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  32.98 
 
 
483 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  36.71 
 
 
484 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  35.81 
 
 
489 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.08 
 
 
479 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  35.81 
 
 
489 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  46.09 
 
 
483 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  33.6 
 
 
492 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  33.13 
 
 
509 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  34.85 
 
 
459 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  41.31 
 
 
498 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  31.25 
 
 
503 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  34.63 
 
 
499 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  35.36 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12630  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.05 
 
 
483 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  43.55 
 
 
499 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  30.67 
 
 
503 aa  156  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  35.24 
 
 
462 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.69 
 
 
469 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1505  Amidase  37.86 
 
 
461 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  35.83 
 
 
477 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  32.72 
 
 
466 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  32.23 
 
 
470 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.1 
 
 
486 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  29.88 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  29.88 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  32.08 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  29.88 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  32.17 
 
 
519 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.3 
 
 
485 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  32.34 
 
 
495 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2037  Amidase  36.83 
 
 
470 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  33.67 
 
 
476 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  33.95 
 
 
495 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  31.03 
 
 
492 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>