More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3826 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2248  amidase  77.48 
 
 
516 aa  733    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  77.46 
 
 
522 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  67.86 
 
 
507 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  70.87 
 
 
508 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  65.87 
 
 
507 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  74.8 
 
 
507 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  74.55 
 
 
507 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  76.6 
 
 
506 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  100 
 
 
509 aa  1015    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1626  Amidase  76.88 
 
 
516 aa  729    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  64.97 
 
 
535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  51.99 
 
 
498 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  50.21 
 
 
498 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  49.05 
 
 
492 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  43.71 
 
 
495 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  40.78 
 
 
477 aa  340  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  43.96 
 
 
463 aa  326  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  41.67 
 
 
475 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  40.83 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  40.13 
 
 
472 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  40.21 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  40.76 
 
 
477 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  41.67 
 
 
494 aa  289  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  41.49 
 
 
494 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  41.49 
 
 
494 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  41.49 
 
 
494 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  39.47 
 
 
473 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  41.88 
 
 
494 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  41.44 
 
 
494 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  41.26 
 
 
494 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  40.62 
 
 
477 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  38.99 
 
 
482 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  44.1 
 
 
472 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  39.04 
 
 
477 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  40.69 
 
 
490 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  40.56 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.49 
 
 
479 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  37.23 
 
 
494 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  37.02 
 
 
491 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  39 
 
 
485 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  38.46 
 
 
494 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  38.85 
 
 
496 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  39.79 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  38.3 
 
 
485 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  36.96 
 
 
471 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  36.38 
 
 
481 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  37.7 
 
 
473 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  40.35 
 
 
468 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  38.41 
 
 
487 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  37.23 
 
 
480 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  39.19 
 
 
485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  38.4 
 
 
505 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  38.72 
 
 
481 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4073  amidase  36.95 
 
 
556 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  36.29 
 
 
475 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  38.57 
 
 
521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  35.64 
 
 
472 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  38.69 
 
 
497 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0285  amidase  38.52 
 
 
485 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  38.69 
 
 
485 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  38.7 
 
 
497 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  38.7 
 
 
484 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  38.7 
 
 
546 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  38.7 
 
 
484 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  38.7 
 
 
484 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  38.7 
 
 
484 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  38.15 
 
 
484 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  36.76 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  35.78 
 
 
492 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  37.37 
 
 
480 aa  226  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  36.16 
 
 
494 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  39.35 
 
 
480 aa  223  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2532  amidase  38.09 
 
 
463 aa  216  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  37.83 
 
 
458 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.63 
 
 
473 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4143  amidase  35.92 
 
 
486 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  35.21 
 
 
499 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.64 
 
 
469 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  36.02 
 
 
469 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.96 
 
 
485 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  35.18 
 
 
469 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3747  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.98 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.814256  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.16 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  35.59 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.13 
 
 
470 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34.27 
 
 
471 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.98 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2827  amidase  35.22 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865048  normal  0.150322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.95 
 
 
485 aa  197  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.92 
 
 
483 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.88 
 
 
482 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.96 
 
 
494 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 
482 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  33.96 
 
 
490 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  36.36 
 
 
469 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.08 
 
 
486 aa  193  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  33.33 
 
 
475 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  33.83 
 
 
490 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  32.68 
 
 
486 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.42 
 
 
470 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>