More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  100 
 
 		 495 aa  962    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  68.54 
 
 		 495 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  47.18 
 
 		 470 aa  329  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  47.18 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  44.62 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  45.69 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  43.23 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  43.2 
 
 		 477 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  46.08 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  44.74 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  42.2 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  43.45 
 
 		 486 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  42.83 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  43.86 
 
 		 488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01110  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  41.86 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  37.22 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  36.88 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  36.95 
 
 		 467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  37.37 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  41.9 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  36.73 
 
 		 471 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  39.05 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  33.33 
 
 		 531 aa  196  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  35.35 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  37.93 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.53 
 
 		 472 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.48 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  35.19 
 
 		 483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  37.66 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.66 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  37.88 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  37.88 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.87 
 
 		 472 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  34.8 
 
 		 475 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  37.52 
 
 		 493 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.94 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  33.4 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  34.17 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.69 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  38.38 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  32.61 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  32.53 
 
 		 476 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.68 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  32.74 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  37.95 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  36.71 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.61 
 
 		 475 aa  171  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.42 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.42 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.42 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.01 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  33.47 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  31.55 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  37.27 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  31.05 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  33.4 
 
 		 481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  35.6 
 
 		 469 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  31.25 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  32.3 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  30.86 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  33.82 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.41 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3007  Amidase  38.13 
 
 		 495 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  31.9 
 
 		 494 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  32.79 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  34.42 
 
 		 477 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  33.47 
 
 		 476 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.17 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  33.4 
 
 		 489 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  33.33 
 
 		 483 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  34.91 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  35.54 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  32.6 
 
 		 542 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  29.19 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  32.87 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.26 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  30.24 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  32.81 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  32.2 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.88 
 
 		 492 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.87 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  33.9 
 
 		 509 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  31.27 
 
 		 519 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  32.31 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  31.89 
 
 		 534 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  36.83 
 
 		 495 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  33 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  33.46 
 
 		 493 aa  156  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  30.11 
 
 		 460 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  33.13 
 
 		 476 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  31.39 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  31.3 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  35.92 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  36.63 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  35.89 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.87 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  35.89 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  32.06 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  35.89 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>