More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2922 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2922  amidase  100 
 
 
493 aa  941    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3007  Amidase  82.83 
 
 
495 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3114  Amidase  82.92 
 
 
493 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  48.06 
 
 
470 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  45.61 
 
 
474 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  44.56 
 
 
503 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  42.92 
 
 
494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.01 
 
 
531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  41.93 
 
 
479 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  37.85 
 
 
503 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  42.74 
 
 
474 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  38.08 
 
 
501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  38.22 
 
 
474 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  38.89 
 
 
476 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.4 
 
 
473 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  38.04 
 
 
495 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  39.36 
 
 
493 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  40.17 
 
 
470 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.92 
 
 
501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  38.79 
 
 
489 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  38.17 
 
 
474 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  36.44 
 
 
476 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  41.68 
 
 
492 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  38.17 
 
 
489 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  40.08 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.54 
 
 
493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  41.48 
 
 
492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  37.97 
 
 
489 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  37.97 
 
 
489 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  38.11 
 
 
482 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  35.23 
 
 
488 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40.12 
 
 
472 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  38.86 
 
 
490 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  39.59 
 
 
483 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.88 
 
 
479 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  37.18 
 
 
476 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  36.14 
 
 
499 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  37.95 
 
 
480 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  37.95 
 
 
480 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  37.95 
 
 
480 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.4 
 
 
496 aa  206  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.86 
 
 
499 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  39.48 
 
 
495 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  33.91 
 
 
470 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  37.92 
 
 
483 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  37.92 
 
 
475 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  39.22 
 
 
522 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  39.39 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  37.47 
 
 
476 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  40.45 
 
 
502 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  38.05 
 
 
475 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  39.26 
 
 
506 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  38.49 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  36.9 
 
 
491 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  36.48 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  35.77 
 
 
481 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  34.1 
 
 
519 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  35.92 
 
 
481 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.92 
 
 
485 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  41.52 
 
 
492 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  36.51 
 
 
484 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  41.55 
 
 
492 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  36.94 
 
 
470 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  36.94 
 
 
470 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  39.76 
 
 
492 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  36.94 
 
 
470 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  39.75 
 
 
476 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.02 
 
 
496 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  38.12 
 
 
521 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  38.12 
 
 
517 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.02 
 
 
494 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.02 
 
 
494 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  39.3 
 
 
477 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  39.63 
 
 
495 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.02 
 
 
494 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  39.83 
 
 
486 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.03 
 
 
496 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  40.08 
 
 
492 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  40.08 
 
 
492 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  37.65 
 
 
493 aa  190  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0789  Amidase  38.64 
 
 
467 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  40.28 
 
 
492 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  36.96 
 
 
477 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  36.59 
 
 
508 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  36 
 
 
468 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  38.82 
 
 
476 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  37.47 
 
 
489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.75 
 
 
492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0666  amidase  37.77 
 
 
466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  32.98 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  38.29 
 
 
504 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  36.96 
 
 
481 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  37.85 
 
 
476 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  38.68 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  36.08 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  34.24 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.81 
 
 
495 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  39.34 
 
 
489 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.74 
 
 
498 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  34.09 
 
 
491 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>