More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1346 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  100 
 
 		 476 aa  933    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  61.92 
 
 		 475 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  58.28 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  57.56 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  58.32 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  57.26 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  56.39 
 
 		 486 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  55.46 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  51.78 
 
 		 488 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  52.41 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  49.28 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  45.17 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  44.67 
 
 		 495 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  42.15 
 
 		 465 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  45.59 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  44.4 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  43.95 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  40.7 
 
 		 467 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  40.35 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  41.26 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  43.74 
 
 		 474 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  40.33 
 
 		 470 aa  256  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.15 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.01 
 
 		 531 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  40.04 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  39.75 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  39.15 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  40.53 
 
 		 501 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  39.26 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  39.47 
 
 		 474 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  39.01 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  40.32 
 
 		 493 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  40.62 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  40.62 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  40.62 
 
 		 480 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  35.95 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.04 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  40.4 
 
 		 473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.32 
 
 		 493 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  35.37 
 
 		 488 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  38.46 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  39.8 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  39.37 
 
 		 495 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  39.67 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  39.51 
 
 		 472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  39.72 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.34 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  40.97 
 
 		 490 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  37.6 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  36.18 
 
 		 501 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  38.81 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  38 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  35.73 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  40.94 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  37.18 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.9 
 
 		 492 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  37.18 
 
 		 489 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  37.18 
 
 		 489 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  40.71 
 
 		 495 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  37.8 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  39.73 
 
 		 500 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  35.1 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  40.91 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  41.32 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  38.49 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.76 
 
 		 498 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  36.51 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  37.17 
 
 		 476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  36.8 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  36.59 
 
 		 494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  37.25 
 
 		 489 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  36.31 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  37.99 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  38.31 
 
 		 495 aa  209  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  36.4 
 
 		 475 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  36.76 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  39.71 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  39.28 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  39.24 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  35.89 
 
 		 467 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  37.87 
 
 		 499 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  36.89 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  39.02 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  34.57 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  33.12 
 
 		 470 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  37.66 
 
 		 463 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  37.07 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  36.78 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.4 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  38.14 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  36.29 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  35.58 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.07 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  39.01 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  35.58 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  35.58 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01110  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.55 
 
 		 502 aa  199  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  34.17 
 
 		 491 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  34.59 
 
 		 483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.41 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>