More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1476 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  100 
 
 
492 aa  975    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  61.78 
 
 
481 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  49.18 
 
 
483 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  46.01 
 
 
472 aa  349  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  45.85 
 
 
482 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  44.12 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  43.57 
 
 
474 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  43.36 
 
 
474 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  42.97 
 
 
502 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  41.54 
 
 
475 aa  293  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  43.51 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  42.62 
 
 
476 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  40.97 
 
 
495 aa  280  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  41.44 
 
 
483 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  41.39 
 
 
481 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  40.2 
 
 
501 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  38.85 
 
 
492 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  36.87 
 
 
503 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  41.54 
 
 
500 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  37.34 
 
 
491 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  41.4 
 
 
489 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  41.5 
 
 
495 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  41.01 
 
 
489 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  41.01 
 
 
489 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.38 
 
 
476 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  42.07 
 
 
489 aa  266  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.33 
 
 
498 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  39.83 
 
 
480 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  39.05 
 
 
519 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  39.83 
 
 
480 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  39.83 
 
 
480 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.3 
 
 
484 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  39.51 
 
 
491 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  40.73 
 
 
473 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  38.45 
 
 
488 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.88 
 
 
493 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  41.5 
 
 
495 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  38.25 
 
 
476 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  40.76 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  40.08 
 
 
509 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.45 
 
 
485 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  38.15 
 
 
493 aa  249  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  39.96 
 
 
495 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  41.94 
 
 
492 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  39.76 
 
 
499 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  37.6 
 
 
499 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  40.54 
 
 
522 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  39.51 
 
 
493 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  40.88 
 
 
479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  40.24 
 
 
506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  36.42 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.68 
 
 
496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  40.68 
 
 
492 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  39.84 
 
 
521 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.35 
 
 
494 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.35 
 
 
496 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.35 
 
 
494 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  39.35 
 
 
517 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.35 
 
 
494 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.31 
 
 
496 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  36.31 
 
 
508 aa  229  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  40.32 
 
 
492 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  40.12 
 
 
504 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  34.24 
 
 
490 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  39.31 
 
 
474 aa  226  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  36.76 
 
 
489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  41.65 
 
 
475 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  36.42 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.91 
 
 
531 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  40.12 
 
 
476 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  40.12 
 
 
492 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  39.51 
 
 
503 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  38.24 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  36.89 
 
 
466 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  35.14 
 
 
470 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  40.08 
 
 
492 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  40.08 
 
 
492 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  40.28 
 
 
492 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  36.16 
 
 
477 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  35.21 
 
 
497 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  40.28 
 
 
475 aa  204  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  39.38 
 
 
484 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2581  Amidase  39.21 
 
 
483 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632619  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  34.41 
 
 
496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  38.28 
 
 
476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  33.77 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  35.8 
 
 
502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  33.99 
 
 
460 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  38.05 
 
 
476 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  40.17 
 
 
485 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  37.5 
 
 
470 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.06 
 
 
473 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  38.24 
 
 
470 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  39.01 
 
 
477 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  33.69 
 
 
479 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  38.93 
 
 
489 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  38.93 
 
 
489 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  38.93 
 
 
489 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  34.45 
 
 
472 aa  190  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.61 
 
 
477 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>