More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0191 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  63.88 
 
 
490 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  100 
 
 
492 aa  1001    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  76.53 
 
 
491 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40.93 
 
 
472 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.85 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  36.82 
 
 
481 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  35.51 
 
 
502 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  36.86 
 
 
495 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  36.67 
 
 
501 aa  243  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  39.55 
 
 
476 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.77 
 
 
498 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  37.88 
 
 
483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  37.27 
 
 
482 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  37.37 
 
 
475 aa  237  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  36.29 
 
 
476 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  35.71 
 
 
493 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  37.52 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.55 
 
 
493 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  33.91 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  33.33 
 
 
531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  34.94 
 
 
481 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.53 
 
 
485 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.69 
 
 
501 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.34 
 
 
473 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  35.17 
 
 
489 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  35.38 
 
 
489 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  35.38 
 
 
489 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  35.76 
 
 
483 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  33.69 
 
 
484 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  33.48 
 
 
480 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  33.48 
 
 
480 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  33.48 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  34.42 
 
 
476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  33.69 
 
 
474 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  37.37 
 
 
495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  37.7 
 
 
493 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  36.47 
 
 
490 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  34.62 
 
 
474 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  31.7 
 
 
503 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  36.76 
 
 
495 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  36.66 
 
 
500 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  35.14 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2581  Amidase  38.21 
 
 
483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632619  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  33.48 
 
 
491 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  35.74 
 
 
474 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  32.08 
 
 
519 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  34.36 
 
 
476 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  34.22 
 
 
474 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  35.75 
 
 
473 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  34.03 
 
 
508 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  37.66 
 
 
496 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.06 
 
 
472 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.81 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.2 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.2 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.2 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.68 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  34.68 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.77 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  34.26 
 
 
499 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  33.83 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  34.74 
 
 
521 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  34 
 
 
475 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  33.26 
 
 
503 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  33.94 
 
 
468 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  31.51 
 
 
479 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  35.46 
 
 
479 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  34.56 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  34.49 
 
 
502 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  32.31 
 
 
477 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  33.33 
 
 
476 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  34.59 
 
 
492 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  33.2 
 
 
476 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  34.5 
 
 
492 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  31.3 
 
 
496 aa  177  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  33.68 
 
 
481 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  32.99 
 
 
470 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  35.47 
 
 
475 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  30.04 
 
 
467 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  34.11 
 
 
492 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  33.96 
 
 
476 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  35.22 
 
 
477 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  33.68 
 
 
468 aa  171  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  30.71 
 
 
497 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  30.21 
 
 
467 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  35.91 
 
 
486 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  32.24 
 
 
470 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  33.33 
 
 
470 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  33.33 
 
 
470 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  31.2 
 
 
502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.62 
 
 
469 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  31.86 
 
 
494 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  35.23 
 
 
470 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  32.88 
 
 
506 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  33.08 
 
 
522 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.18 
 
 
473 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  36.64 
 
 
488 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0666  amidase  33.69 
 
 
466 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  33.91 
 
 
476 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.8 
 
 
477 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>