More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0189 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  73.68 
 
 		 517 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  73.59 
 
 		 494 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  73.68 
 
 		 496 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  88.21 
 
 		 492 aa  785    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  73.59 
 
 		 494 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  73.89 
 
 		 496 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  90.65 
 
 		 492 aa  838    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  73.59 
 
 		 494 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  73.68 
 
 		 521 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  72.78 
 
 		 496 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  98.98 
 
 		 492 aa  979    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  90.85 
 
 		 492 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  100 
 
 		 492 aa  988    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  90.85 
 
 		 492 aa  822    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  90.85 
 
 		 492 aa  820    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  65.22 
 
 		 522 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  64.75 
 
 		 506 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  65.21 
 
 		 504 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  43.02 
 
 		 519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  42.26 
 
 		 501 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  44.69 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  40.16 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  43.03 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  43.98 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  42.17 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  42.17 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  41.97 
 
 		 489 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  43.43 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  42.19 
 
 		 474 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  44.35 
 
 		 495 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  44.18 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  44.8 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  41.25 
 
 		 476 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  40.37 
 
 		 473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  43.09 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  41.92 
 
 		 499 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  41.97 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  39.44 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  42.13 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  42.28 
 
 		 493 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  41.08 
 
 		 475 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  41.99 
 
 		 489 aa  280  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  40.37 
 
 		 476 aa  279  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  43.75 
 
 		 495 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  42.2 
 
 		 490 aa  269  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  41.08 
 
 		 495 aa  269  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  41.48 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  41.73 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  39.33 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  39.12 
 
 		 482 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40.6 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  38.85 
 
 		 491 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  38.98 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  40.33 
 
 		 494 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  39.47 
 
 		 483 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  38.45 
 
 		 480 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  38.45 
 
 		 480 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  38.45 
 
 		 480 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  38.66 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.22 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  38.24 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.63 
 
 		 483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  40.69 
 
 		 479 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  42.54 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  36.69 
 
 		 531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  37.85 
 
 		 497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  39.33 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  40.91 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  41.35 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.49 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  37.5 
 
 		 476 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  41.32 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  41.32 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  41.32 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.28 
 
 		 470 aa  228  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  38.48 
 
 		 481 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.15 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  37.32 
 
 		 468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.81 
 
 		 476 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.69 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  37.5 
 
 		 470 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  37.5 
 
 		 470 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.81 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.17 
 
 		 498 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  35.33 
 
 		 491 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  34.16 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  37.3 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  36.57 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  34.5 
 
 		 492 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  33.6 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  37.07 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  37.75 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  40.92 
 
 		 493 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  37.45 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  31.67 
 
 		 486 aa  192  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  34.01 
 
 		 481 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  32.55 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  31.94 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  38.72 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  33.07 
 
 		 490 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>