More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1781 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  73.63 
 
 
493 aa  648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  100 
 
 
493 aa  977    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  56.25 
 
 
489 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  55.96 
 
 
489 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  55.96 
 
 
489 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  55.53 
 
 
489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  55.04 
 
 
490 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  55.78 
 
 
492 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  50.51 
 
 
499 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  49.79 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  48.17 
 
 
493 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  47.56 
 
 
501 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  53.89 
 
 
496 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  47.24 
 
 
509 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  45.67 
 
 
508 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  42.32 
 
 
503 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  44.2 
 
 
519 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  47.18 
 
 
499 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  47.08 
 
 
495 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  46.61 
 
 
500 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  42.89 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  47.38 
 
 
495 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  41.73 
 
 
474 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  44.27 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  44.47 
 
 
492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  41.33 
 
 
474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.33 
 
 
496 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.33 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.33 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.33 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  41.82 
 
 
476 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  43.66 
 
 
496 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  42.94 
 
 
479 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  44.44 
 
 
517 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  44.24 
 
 
496 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  45.38 
 
 
502 aa  296  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  44.24 
 
 
521 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  41.29 
 
 
481 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  40.33 
 
 
497 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  41.37 
 
 
506 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  40.37 
 
 
483 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  39.51 
 
 
488 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  41.29 
 
 
522 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  38.6 
 
 
531 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  40.61 
 
 
483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40.93 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  38.75 
 
 
488 aa  286  4e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  39.6 
 
 
476 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  39.03 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  40.81 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  43.79 
 
 
492 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.62 
 
 
498 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  38.59 
 
 
496 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  40.95 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  39.83 
 
 
470 aa  273  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  38.43 
 
 
476 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.63 
 
 
501 aa  269  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  42.8 
 
 
492 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  42.8 
 
 
492 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  43 
 
 
492 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  39.06 
 
 
480 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  39.06 
 
 
480 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  39.06 
 
 
480 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  38.65 
 
 
491 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  41.83 
 
 
481 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  42.21 
 
 
492 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.77 
 
 
473 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  41.78 
 
 
504 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  38.45 
 
 
484 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  38.22 
 
 
479 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.52 
 
 
492 aa  250  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  41.11 
 
 
475 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  34.65 
 
 
486 aa  248  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  42.25 
 
 
489 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  42.25 
 
 
489 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  40.4 
 
 
476 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  42.45 
 
 
489 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  39.1 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  37.65 
 
 
468 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  40.28 
 
 
495 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.08 
 
 
485 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  39.28 
 
 
503 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  38.18 
 
 
474 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  37.73 
 
 
492 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  38.17 
 
 
470 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  38.17 
 
 
470 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  38.17 
 
 
470 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  36.44 
 
 
502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  37.73 
 
 
467 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  41 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  36.25 
 
 
491 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  40.16 
 
 
486 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  38.45 
 
 
467 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  36.51 
 
 
467 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  39.18 
 
 
470 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  39.34 
 
 
468 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  35.17 
 
 
490 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  40 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  36.86 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  35.77 
 
 
489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>