More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1519 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1519  amidase  100 
 
 
488 aa  998    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  48.33 
 
 
486 aa  405  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  45.34 
 
 
499 aa  359  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  42.15 
 
 
508 aa  345  8.999999999999999e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  39.54 
 
 
501 aa  310  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1474  amidase family protein  38.48 
 
 
680 aa  289  8e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223494  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0866  cell wall anchor domain-containing protein  38.87 
 
 
637 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.373011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  37.79 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.83 
 
 
493 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  37.76 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  36.72 
 
 
495 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0612  Amidase  36.31 
 
 
529 aa  272  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  36.38 
 
 
503 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  37.84 
 
 
509 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  38.61 
 
 
493 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  36.31 
 
 
519 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  36.65 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  35.76 
 
 
475 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  35.28 
 
 
489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  35.28 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  35.28 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  35.45 
 
 
499 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  35.07 
 
 
490 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  37.66 
 
 
496 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  35.92 
 
 
474 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  32.56 
 
 
476 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  35.39 
 
 
501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  33.96 
 
 
474 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  34.92 
 
 
492 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  32.42 
 
 
476 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  33.05 
 
 
474 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  36.29 
 
 
502 aa  210  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.68 
 
 
473 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  35.76 
 
 
495 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  35.46 
 
 
500 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  34.3 
 
 
472 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  32.11 
 
 
531 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  32 
 
 
480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  32 
 
 
480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  32 
 
 
480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  34.52 
 
 
474 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  32.77 
 
 
491 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  32.56 
 
 
484 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  32.59 
 
 
497 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  30.7 
 
 
488 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  35 
 
 
495 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  29.88 
 
 
498 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  33.26 
 
 
481 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  34.35 
 
 
467 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  32.7 
 
 
482 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  34.15 
 
 
467 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.72 
 
 
485 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  32.92 
 
 
495 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  33.75 
 
 
494 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  33.13 
 
 
483 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  31.87 
 
 
503 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  29.46 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  31.97 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  33.33 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  31.58 
 
 
483 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  32.15 
 
 
492 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  30.8 
 
 
479 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  28.82 
 
 
460 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  31.95 
 
 
476 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  33.33 
 
 
476 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  31.61 
 
 
476 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  30.74 
 
 
496 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  30.08 
 
 
522 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  29.39 
 
 
477 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  31.81 
 
 
489 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  31.81 
 
 
489 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  31.81 
 
 
489 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  31.94 
 
 
492 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  30.29 
 
 
489 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.51 
 
 
496 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.51 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  29.92 
 
 
506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.51 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.51 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.51 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  31.51 
 
 
517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  31.51 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  30.96 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  31.96 
 
 
475 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.04 
 
 
492 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  33.05 
 
 
473 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  30 
 
 
490 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  32.58 
 
 
476 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  32.47 
 
 
492 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  32.99 
 
 
470 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  30.35 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  31.71 
 
 
465 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  28.93 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  31.52 
 
 
476 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  32.02 
 
 
476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  30.56 
 
 
492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  32.84 
 
 
492 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  31.69 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  31.69 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  31.69 
 
 
492 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>