More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4559 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  100 
 
 		 496 aa  985    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  58.99 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  58.99 
 
 		 489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  58.99 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  59.43 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  56.57 
 
 		 490 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  54.69 
 
 		 492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  54.51 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  53.89 
 
 		 493 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  50.2 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  47.68 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  47.14 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  41.75 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  46.14 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  43.61 
 
 		 501 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  46.49 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  43.16 
 
 		 519 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  46.89 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  45.83 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  41.89 
 
 		 508 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  45.01 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.06 
 
 		 496 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  46.15 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.15 
 
 		 496 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.15 
 
 		 494 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.15 
 
 		 494 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.15 
 
 		 494 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  45.95 
 
 		 521 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  43.98 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  43.03 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  43.06 
 
 		 474 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  43.09 
 
 		 499 aa  295  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  41.95 
 
 		 522 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  43.57 
 
 		 476 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  41.05 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  41.88 
 
 		 483 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  41.31 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  43.26 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  43.48 
 
 		 504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  42.28 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  42.54 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  42.51 
 
 		 472 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  41.87 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  40.76 
 
 		 482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.78 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.16 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  43.2 
 
 		 492 aa  273  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  37.25 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  39.4 
 
 		 479 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  37.71 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  41.99 
 
 		 492 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  41.99 
 
 		 492 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  42.8 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  37.42 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  42.19 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.65 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  40.28 
 
 		 491 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  39.71 
 
 		 480 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  39.71 
 
 		 480 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  39.71 
 
 		 480 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  42.19 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.88 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  35.87 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.59 
 
 		 501 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  37.27 
 
 		 490 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  39.68 
 
 		 503 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  38.16 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  37.5 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.92 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  39.2 
 
 		 481 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  37.04 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  37.76 
 
 		 496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.77 
 
 		 473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  37.88 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  38.23 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.83 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.23 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  33.06 
 
 		 486 aa  227  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  36.98 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  39.15 
 
 		 470 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  43.29 
 
 		 489 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  43.29 
 
 		 489 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  43.29 
 
 		 489 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  36.42 
 
 		 489 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  38.34 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  34.84 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  34.34 
 
 		 499 aa  216  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  37.83 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  35.62 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  39.56 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  33.95 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.35 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  37.85 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  37.22 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  36.38 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  38.08 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1474  amidase family protein  32.3 
 
 		 680 aa  205  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  38.4 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  32.77 
 
 		 460 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  37.45 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>