More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0183 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  71.17 
 
 
494 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  71.66 
 
 
521 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  71.26 
 
 
496 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  71.17 
 
 
494 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  71.86 
 
 
496 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  88.41 
 
 
492 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  89.84 
 
 
492 aa  800    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  70.77 
 
 
496 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  71.66 
 
 
517 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  100 
 
 
492 aa  978    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  89.63 
 
 
492 aa  801    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  88.21 
 
 
492 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  87.6 
 
 
492 aa  824    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  89.63 
 
 
492 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  71.17 
 
 
494 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  64.75 
 
 
522 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  64.55 
 
 
506 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  65.08 
 
 
504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  42.17 
 
 
519 aa  309  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  41.11 
 
 
501 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  42.01 
 
 
493 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  43.49 
 
 
499 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  38.17 
 
 
503 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  41.68 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  41.68 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  41.48 
 
 
489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  39.31 
 
 
488 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  40.81 
 
 
474 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  44.27 
 
 
495 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  40.29 
 
 
491 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  44.65 
 
 
492 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  42.52 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  40.4 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  44.09 
 
 
500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  41.32 
 
 
499 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  43.12 
 
 
474 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  41.77 
 
 
474 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  42.48 
 
 
490 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  40.65 
 
 
474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  42.48 
 
 
502 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  39.47 
 
 
480 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  39.64 
 
 
482 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  39.47 
 
 
480 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  39.47 
 
 
480 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.82 
 
 
476 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  41 
 
 
509 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  40.72 
 
 
493 aa  266  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  41.16 
 
 
495 aa  266  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  39.32 
 
 
508 aa  266  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  40.97 
 
 
489 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  39.47 
 
 
484 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  39.03 
 
 
476 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  41.58 
 
 
494 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  43.86 
 
 
495 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  41.12 
 
 
503 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.62 
 
 
473 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  38.85 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  40.52 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  43.41 
 
 
496 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  40.77 
 
 
479 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.97 
 
 
483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  39.48 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.44 
 
 
501 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  37.52 
 
 
497 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  37.42 
 
 
496 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  36.59 
 
 
531 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  39.59 
 
 
470 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  39.45 
 
 
495 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  42.25 
 
 
489 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  42.25 
 
 
489 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  42.25 
 
 
489 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  39.45 
 
 
485 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.68 
 
 
470 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  36.97 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.72 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  35.83 
 
 
476 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  36.61 
 
 
470 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  36.61 
 
 
470 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  36.61 
 
 
470 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.13 
 
 
472 aa  210  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  36.49 
 
 
481 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  42.04 
 
 
493 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.21 
 
 
476 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  33.95 
 
 
470 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  37.97 
 
 
468 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.16 
 
 
473 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.51 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.03 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  38.38 
 
 
476 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  35.21 
 
 
491 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  34.45 
 
 
467 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  34.01 
 
 
492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  35.83 
 
 
502 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  32.57 
 
 
488 aa  195  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  34.86 
 
 
481 aa  193  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  32.84 
 
 
460 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  38.58 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  32.2 
 
 
460 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3007  Amidase  41.19 
 
 
495 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  31.29 
 
 
472 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>