More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2910 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  954    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  97.83 
 
 
460 aa  892    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  33.76 
 
 
476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  34.26 
 
 
476 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.64 
 
 
501 aa  230  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  32.39 
 
 
488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  33.26 
 
 
495 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  33.61 
 
 
503 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  33 
 
 
519 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  35.27 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  32.01 
 
 
476 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  33.33 
 
 
508 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  32.05 
 
 
531 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  34.97 
 
 
489 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  33.26 
 
 
491 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  33.33 
 
 
484 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  33.12 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  34.5 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  32.75 
 
 
480 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  32.75 
 
 
480 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  32.75 
 
 
480 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  33.96 
 
 
474 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  32.03 
 
 
481 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  32.97 
 
 
483 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  32.54 
 
 
499 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.55 
 
 
473 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  33.69 
 
 
476 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  34.02 
 
 
495 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  33.33 
 
 
475 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  33.9 
 
 
476 aa  206  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.74 
 
 
493 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.9 
 
 
498 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  33.67 
 
 
500 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.4 
 
 
496 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  32.86 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  32.73 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  34.32 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  32.24 
 
 
489 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  33.05 
 
 
474 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  33.9 
 
 
481 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.82 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  31.77 
 
 
483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  33.82 
 
 
521 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  31.49 
 
 
489 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  33.4 
 
 
504 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  32.58 
 
 
502 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  32.28 
 
 
472 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  32.69 
 
 
486 aa  196  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.03 
 
 
494 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.96 
 
 
496 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  34.03 
 
 
517 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.03 
 
 
494 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.03 
 
 
494 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.03 
 
 
496 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  31.49 
 
 
489 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  31.49 
 
 
489 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  31.34 
 
 
502 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  34.02 
 
 
495 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  30.06 
 
 
493 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  29.47 
 
 
499 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  33.2 
 
 
492 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  33.47 
 
 
482 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  32.72 
 
 
490 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  30.9 
 
 
495 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  32.99 
 
 
492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  30.95 
 
 
485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  31.84 
 
 
476 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  29.1 
 
 
488 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  30.41 
 
 
476 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  33.48 
 
 
493 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  33.77 
 
 
494 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0172  amidase  29.44 
 
 
499 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  31.55 
 
 
470 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  30.56 
 
 
470 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1474  amidase family protein  29.88 
 
 
680 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  30.19 
 
 
479 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  31.29 
 
 
474 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  30.02 
 
 
475 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  32.55 
 
 
492 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6180  Amidase  31.3 
 
 
470 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579752  normal  0.528616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  30.55 
 
 
479 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  32.14 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  29.48 
 
 
481 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  31.61 
 
 
497 aa  166  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  32.84 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.74 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  29.44 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  32.02 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0612  Amidase  28.12 
 
 
529 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  29.22 
 
 
470 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  29.22 
 
 
470 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  32.13 
 
 
492 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0866  cell wall anchor domain-containing protein  30.13 
 
 
637 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.373011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  32.13 
 
 
492 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.13 
 
 
495 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  32.34 
 
 
492 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3309  amidase  31.04 
 
 
465 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  30.39 
 
 
477 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6359  Amidase  29.41 
 
 
470 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  30.89 
 
 
476 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>