More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2041 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1976  amidase  99.15 
 
 		 470 aa  931    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  100 
 
 		 470 aa  938    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  77.68 
 
 		 468 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  100 
 
 		 470 aa  938    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  78.85 
 
 		 468 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  65.81 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0666  amidase  64.96 
 
 		 466 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  44.64 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  46 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  46.17 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  45.24 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0789  Amidase  45.22 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  40.64 
 
 		 474 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  39.39 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  37.86 
 
 		 489 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  37.27 
 
 		 489 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  37.06 
 
 		 489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  37.06 
 
 		 489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  35.23 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  40.09 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  38.17 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  35.79 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  39.75 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.81 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  37.71 
 
 		 474 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  36.42 
 
 		 490 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  37.47 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  37.26 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.73 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  35.49 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  35.85 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  36.02 
 
 		 483 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.65 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  37.47 
 
 		 474 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.37 
 
 		 496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  37.37 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  37.37 
 
 		 517 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  35.83 
 
 		 522 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  34.82 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.97 
 
 		 482 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.37 
 
 		 496 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.37 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.37 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.37 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  35.08 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  37.5 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  36.53 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  35.7 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  37.3 
 
 		 492 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  34.13 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  36.46 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.47 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  36.2 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  36.18 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  32.98 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  36.93 
 
 		 492 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.32 
 
 		 531 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  32.92 
 
 		 491 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  33.53 
 
 		 503 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  35.46 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  34.29 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  34.33 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  35.02 
 
 		 508 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  34.33 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  34.33 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  31.85 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  36.4 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  36.33 
 
 		 501 aa  172  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  37.55 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  37.55 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.1 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  35.7 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  32.04 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  36.66 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  36.82 
 
 		 476 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  37.55 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  35.61 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  30.51 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  36.54 
 
 		 493 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  33.97 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  33.55 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  34.3 
 
 		 495 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  33.67 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  33.61 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  28.27 
 
 		 486 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  34.07 
 
 		 476 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  30.08 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  31.71 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  34.73 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  31.54 
 
 		 490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  29.64 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  35.28 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  30.74 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  34.78 
 
 		 496 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  34.6 
 
 		 495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  37.05 
 
 		 475 aa  153  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  36.07 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  37.73 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  28.25 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  31.92 
 
 		 497 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>