More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3358 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3358  amidase  100 
 
 		 470 aa  919    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  56.93 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  54.83 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  56.93 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  56.03 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  51.27 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  53.7 
 
 		 488 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  51.99 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  53.07 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  49.16 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  52.96 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  47.18 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  47.8 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  44.58 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  42.39 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  46.46 
 
 		 476 aa  283  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  43.6 
 
 		 467 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  40.58 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  39.87 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  39.12 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  38.88 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  40.25 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  38.84 
 
 		 474 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  40.04 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  38.51 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  34.36 
 
 		 488 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  38.78 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  36.44 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  39.45 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  39.29 
 
 		 491 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  39.58 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  40.29 
 
 		 483 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  35.19 
 
 		 477 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  35.49 
 
 		 531 aa  229  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  36.96 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.48 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  35.42 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  38.75 
 
 		 484 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  38.46 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  39.72 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  38.46 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  38.46 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  39.72 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  39.72 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  35.42 
 
 		 472 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  39.57 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  39.71 
 
 		 499 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  39.48 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  40.08 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  39.52 
 
 		 489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.76 
 
 		 476 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.9 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.5 
 
 		 498 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  39.62 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  40.76 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  38.97 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  39.28 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  35.6 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  40.6 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  38.48 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  36.25 
 
 		 481 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.13 
 
 		 473 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  40.4 
 
 		 500 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  37.92 
 
 		 509 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  40.8 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.16 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  37.2 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.58 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  37.83 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.58 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.58 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.58 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  39.87 
 
 		 489 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  39.87 
 
 		 489 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  39.87 
 
 		 489 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  37.38 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  40.32 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  37.66 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.9 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  37.9 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  41.26 
 
 		 492 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  36.4 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  37.4 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  36.71 
 
 		 495 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  39.08 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  37.37 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  36.12 
 
 		 474 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.49 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  40.21 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  37.82 
 
 		 475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  37.83 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.21 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  35.67 
 
 		 466 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  36.51 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  38.37 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  34.79 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  40.6 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  37.9 
 
 		 504 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  37.97 
 
 		 493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  32.23 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>