More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2241 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  100 
 
 
471 aa  934    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  44.42 
 
 
476 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  42.09 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  41.26 
 
 
475 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  42.77 
 
 
476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0232  Amidase  42.61 
 
 
472 aa  243  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  42.46 
 
 
486 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  39.74 
 
 
476 aa  227  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  38.82 
 
 
483 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  38.14 
 
 
467 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  37.89 
 
 
481 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  41.83 
 
 
477 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  36.48 
 
 
465 aa  217  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  35.93 
 
 
467 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  35.93 
 
 
467 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  40.35 
 
 
476 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  35.74 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  38.23 
 
 
493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  40.6 
 
 
470 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  35.38 
 
 
476 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.38 
 
 
485 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.68 
 
 
493 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  39.16 
 
 
474 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  38.36 
 
 
466 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.94 
 
 
495 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  33.96 
 
 
488 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  33.33 
 
 
503 aa  200  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  39.66 
 
 
488 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  39.2 
 
 
509 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  37.23 
 
 
474 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  37.21 
 
 
491 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  37.82 
 
 
475 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  35.85 
 
 
519 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  34.79 
 
 
476 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  38.16 
 
 
495 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  35.93 
 
 
489 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  35.08 
 
 
474 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  37 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  37 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  37 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  37 
 
 
484 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  35.8 
 
 
502 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  37.68 
 
 
502 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  37.53 
 
 
493 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.52 
 
 
473 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  36 
 
 
499 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.16 
 
 
485 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  38.03 
 
 
484 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  40.84 
 
 
469 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.47 
 
 
472 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  35.77 
 
 
476 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  34.71 
 
 
495 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  35.34 
 
 
489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  35.34 
 
 
489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  41.95 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  35.34 
 
 
489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  38 
 
 
504 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  33.97 
 
 
469 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.12 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.08 
 
 
473 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.1 
 
 
492 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  32.76 
 
 
468 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  34.68 
 
 
479 aa  179  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  35.85 
 
 
479 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  34.76 
 
 
471 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  39.02 
 
 
502 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  36.34 
 
 
467 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  34.71 
 
 
468 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.58 
 
 
484 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.03 
 
 
531 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  36.38 
 
 
495 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  35.92 
 
 
471 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  35.58 
 
 
470 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  33.6 
 
 
508 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  35.86 
 
 
522 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  35.08 
 
 
474 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  33.74 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.47 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  36.76 
 
 
501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  36.09 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0921  amidase  37.92 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  37.31 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  34.86 
 
 
499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  35.34 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  35.2 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.06 
 
 
494 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.57 
 
 
491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.45 
 
 
498 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  32.28 
 
 
491 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  34.33 
 
 
461 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  37.2 
 
 
475 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.9 
 
 
486 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.33 
 
 
477 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  30.31 
 
 
486 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  35.89 
 
 
495 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  35.77 
 
 
470 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  38.17 
 
 
492 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  34.66 
 
 
506 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  37.74 
 
 
462 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>