More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4260 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  100 
 
 		 471 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  59.91 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  61.98 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  49.34 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  46.14 
 
 		 474 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  43.2 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  44.61 
 
 		 474 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  47.17 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  46.55 
 
 		 504 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  43.99 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  43.2 
 
 		 469 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  43.91 
 
 		 469 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  43.04 
 
 		 469 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  43.21 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  40.77 
 
 		 469 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  41.14 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  39.09 
 
 		 468 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  43.19 
 
 		 469 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  39.48 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  36.27 
 
 		 477 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  40.35 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  43.3 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  39.57 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  40.56 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  36.25 
 
 		 475 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  35.13 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  41.55 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  39 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  37.47 
 
 		 492 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  42.79 
 
 		 469 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  37.5 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  36.77 
 
 		 475 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  40.35 
 
 		 469 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  37.91 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.26 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  37.88 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  35.93 
 
 		 490 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.8 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  32.77 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  37.53 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  33.4 
 
 		 475 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  35.34 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  36.29 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  38.23 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  35.52 
 
 		 496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.15 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.87 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  34.77 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  34.85 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.73 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  32.33 
 
 		 459 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  35.24 
 
 		 486 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  33.69 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  33.48 
 
 		 490 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  32.97 
 
 		 487 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  34.14 
 
 		 475 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  33.76 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  34.47 
 
 		 461 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  32.82 
 
 		 483 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  33.56 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.13 
 
 		 479 aa  186  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  33.76 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  32.55 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  36.02 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  33.91 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.31 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  32.82 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.43 
 
 		 461 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.29 
 
 		 485 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  32.69 
 
 		 485 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  33.05 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  32.07 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.89 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.68 
 
 		 488 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.88 
 
 		 491 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  37.05 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  30.94 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  35.13 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  33.9 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  34.03 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.62 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  33.9 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.47 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  34.1 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  34.68 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  30.39 
 
 		 495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.24 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  31.43 
 
 		 494 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  31.22 
 
 		 534 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  31.6 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  34.38 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  31.43 
 
 		 494 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  32.04 
 
 		 485 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.78 
 
 		 486 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  32.44 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.49 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  34.63 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  32.91 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  34.43 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  32.55 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>