More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4750 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4750  Amidase  100 
 
 		 504 aa  991    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  58.46 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  54 
 
 		 471 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  54.21 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  54 
 
 		 469 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  54.21 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  54.06 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1909  Amidase  55.63 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.769881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  50.97 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  51.73 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  46.51 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4085  Amidase  52.97 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  48.03 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  51.42 
 
 		 469 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  48.09 
 
 		 474 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  53.16 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  47.28 
 
 		 474 aa  326  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3137  amidase  44.61 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  42.17 
 
 		 483 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  46.77 
 
 		 471 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  46.67 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  45.59 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  40.39 
 
 		 468 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  39.78 
 
 		 475 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  43.26 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  43.11 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  40.66 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  44.88 
 
 		 473 aa  286  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  44.04 
 
 		 475 aa  286  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  44.01 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  39.7 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  43.11 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  41.44 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  38.84 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  37.95 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  41.92 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  38.59 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  39.27 
 
 		 464 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2125  amidase  39.24 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  38.03 
 
 		 490 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  38.43 
 
 		 473 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  39.55 
 
 		 475 aa  243  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  40.38 
 
 		 463 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  40.47 
 
 		 490 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  37.29 
 
 		 487 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  40.26 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  40.34 
 
 		 493 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  38.19 
 
 		 475 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4356  amidase  39.74 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0637971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  36.68 
 
 		 470 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.47 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  35.81 
 
 		 470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  40.47 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  37.89 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4488  amidase  39.08 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  39.48 
 
 		 466 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  39.19 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  37.18 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  37.45 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  39.1 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  39.02 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  42.28 
 
 		 477 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55200  amidase  38.7 
 
 		 464 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772002  hitchhiker  0.00000000118324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1257  amidase  38.65 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1265  amidase  38.65 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1403  amidase  38.43 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1032  amidase  38.43 
 
 		 464 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  39.17 
 
 		 495 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5648  amidase  36.84 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0140  amidase  38.88 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  37.07 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  39.49 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1864  amidase  38.48 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1098  amidase  38.48 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0454  amidase  42.76 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329272  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0886  amidase  40.77 
 
 		 467 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0815  amidase  40.56 
 
 		 467 aa  223  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  36.09 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  36.21 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  38.82 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  37.95 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  38.59 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  35.61 
 
 		 494 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  35.79 
 
 		 494 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3929  amidase  36.89 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  40.6 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  35.37 
 
 		 494 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  36.29 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  37.66 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1621  amidase  40.86 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2205  amidase  39.65 
 
 		 484 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  32.29 
 
 		 495 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  35.37 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  35.37 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  35.37 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  36.91 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  38.48 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  36.15 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0381  amidase  37.99 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  39.87 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>