More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0232 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0232  Amidase  100 
 
 		 472 aa  903    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  43.25 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  34.93 
 
 		 531 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  37.95 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  42.49 
 
 		 476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  38.15 
 
 		 495 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  39.1 
 
 		 466 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  38.19 
 
 		 503 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  37.69 
 
 		 477 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  35.11 
 
 		 474 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  36.78 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  38.77 
 
 		 499 aa  203  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  38.91 
 
 		 509 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.19 
 
 		 470 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.82 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  38.13 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  35.99 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  38.18 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  34.1 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  34.37 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  33.95 
 
 		 467 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  37.63 
 
 		 474 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  33.95 
 
 		 474 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  36.4 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  39.36 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.4 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  37.78 
 
 		 492 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.02 
 
 		 496 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  35.56 
 
 		 522 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  33.79 
 
 		 503 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  36.06 
 
 		 494 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  37.78 
 
 		 492 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  39.53 
 
 		 502 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  39.03 
 
 		 500 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  33.12 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  32.62 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.94 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  36.35 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.85 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  38.27 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  34.4 
 
 		 508 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  38.91 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  32.22 
 
 		 488 aa  186  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  34.77 
 
 		 476 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  35.51 
 
 		 476 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  35.8 
 
 		 499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  34.6 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.68 
 
 		 496 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  38.28 
 
 		 521 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  35.17 
 
 		 506 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  37.95 
 
 		 476 aa  183  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  37.47 
 
 		 517 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.52 
 
 		 494 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.52 
 
 		 494 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.52 
 
 		 494 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.52 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.61 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  35.91 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  34.16 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  39.56 
 
 		 495 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  35.98 
 
 		 489 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  38.62 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.53 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  34.18 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  38.78 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  36.33 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  35.77 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  35.77 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  36.16 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  34.94 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3309  amidase  35.92 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  33.88 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  37.86 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  39.08 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  35.7 
 
 		 483 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  34.99 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  37.37 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2922  amidase  40.53 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.275961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.78 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2094  Amidase  33.8 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  33.68 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  37.47 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  34.08 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6359  Amidase  36.65 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  34.74 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  31.91 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  35.8 
 
 		 519 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12389  amidase  34.8 
 
 		 484 aa  170  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  31.78 
 
 		 479 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  36.07 
 
 		 476 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.59 
 
 		 469 aa  169  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  34.71 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  36.68 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  34.78 
 
 		 496 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.37 
 
 		 492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  35.52 
 
 		 468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  34.67 
 
 		 463 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  36.84 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  33.97 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  34.75 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>