More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3309 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3309  amidase  100 
 
 
465 aa  923    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6180  Amidase  55.56 
 
 
470 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579752  normal  0.528616 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6359  Amidase  53.94 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  52.03 
 
 
469 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5337  amidase  52.78 
 
 
471 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969017  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1304  amidase  41.77 
 
 
437 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448895  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  33.47 
 
 
488 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  34.71 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  35.67 
 
 
470 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  34.29 
 
 
495 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  37.44 
 
 
483 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  33.54 
 
 
483 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  33.12 
 
 
472 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  36.05 
 
 
490 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  33.6 
 
 
489 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.93 
 
 
501 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  34.61 
 
 
476 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  34.49 
 
 
489 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  34.49 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  34.49 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  33.07 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  36.3 
 
 
489 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  33.68 
 
 
501 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  35.26 
 
 
474 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  32.5 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  36.4 
 
 
492 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  31.87 
 
 
491 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  35.25 
 
 
499 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  34.36 
 
 
497 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  34.97 
 
 
503 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  31.59 
 
 
531 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.62 
 
 
498 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  31.78 
 
 
492 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  34.46 
 
 
472 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  34.13 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  32.77 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  32.48 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  32.79 
 
 
499 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.92 
 
 
473 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  35.41 
 
 
476 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  38.57 
 
 
476 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  37.89 
 
 
476 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  34.11 
 
 
482 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  30.77 
 
 
470 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  32.81 
 
 
519 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  35.88 
 
 
476 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  32.18 
 
 
496 aa  168  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  30.75 
 
 
460 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  36.93 
 
 
486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  32.33 
 
 
508 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  37 
 
 
488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  29.18 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.94 
 
 
493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  32.94 
 
 
493 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  30.3 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  38.34 
 
 
480 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.55 
 
 
496 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  34.55 
 
 
521 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  34.26 
 
 
466 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  31.49 
 
 
476 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.34 
 
 
494 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.34 
 
 
494 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.34 
 
 
494 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  34.55 
 
 
517 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.34 
 
 
496 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  35.12 
 
 
476 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  32.77 
 
 
502 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  32.7 
 
 
475 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  34.27 
 
 
502 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  33.2 
 
 
492 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  32.99 
 
 
493 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  33.81 
 
 
492 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  35 
 
 
495 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  33.81 
 
 
492 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.36 
 
 
485 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0232  Amidase  36.53 
 
 
472 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  32.65 
 
 
473 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  32.79 
 
 
465 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2581  Amidase  35.9 
 
 
483 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632619  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32.87 
 
 
495 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  30.72 
 
 
474 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  30.74 
 
 
480 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  32.29 
 
 
502 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  30.74 
 
 
480 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  30.74 
 
 
480 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  29.13 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  32.22 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.28 
 
 
489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  32.76 
 
 
474 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  35.77 
 
 
488 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  32.29 
 
 
491 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  35.14 
 
 
477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  32.56 
 
 
481 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  31.82 
 
 
477 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.67 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  29.73 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0280  Amidase  33.82 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  34.77 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  33.48 
 
 
474 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  33.05 
 
 
467 aa  146  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>