More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1304 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1304  amidase  100 
 
 
437 aa  849    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448895  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3309  amidase  41.77 
 
 
465 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6180  Amidase  40.08 
 
 
470 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579752  normal  0.528616 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5337  amidase  40.09 
 
 
471 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969017  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.77 
 
 
469 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6359  Amidase  38.7 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  31.03 
 
 
470 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  34.27 
 
 
509 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  33.83 
 
 
489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  32.13 
 
 
481 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  34.32 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  33.61 
 
 
489 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  33.61 
 
 
489 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  33.4 
 
 
489 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  29.74 
 
 
460 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  34.36 
 
 
476 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  32.59 
 
 
483 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  30.58 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  29.21 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  31.57 
 
 
491 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32 
 
 
493 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  32.03 
 
 
493 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.19 
 
 
492 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2581  Amidase  35.06 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632619  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  30.19 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  31.68 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  32.63 
 
 
495 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  30.97 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  29.4 
 
 
531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  32.4 
 
 
492 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  28.76 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  29.94 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  42.92 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  31.43 
 
 
475 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  29.38 
 
 
492 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  33.01 
 
 
476 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  33.33 
 
 
476 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  29.45 
 
 
468 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  33.48 
 
 
474 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  32.93 
 
 
474 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  30.51 
 
 
470 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  30.51 
 
 
470 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  33 
 
 
474 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  30.7 
 
 
470 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  31.45 
 
 
519 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  28.98 
 
 
472 aa  123  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  33.99 
 
 
470 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  31.84 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.47 
 
 
496 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.47 
 
 
494 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.47 
 
 
494 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.47 
 
 
494 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  32.51 
 
 
489 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  30.12 
 
 
473 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  32.19 
 
 
475 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.95 
 
 
496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  33.47 
 
 
517 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.47 
 
 
496 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  33.47 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  28.85 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  31.34 
 
 
498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  33.58 
 
 
494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  33.25 
 
 
503 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  28.85 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  32.7 
 
 
496 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  31.43 
 
 
499 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  31.61 
 
 
495 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  31.82 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  31.21 
 
 
500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  28.92 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.53 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  33.5 
 
 
492 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  29.87 
 
 
482 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  33.11 
 
 
479 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  31.26 
 
 
499 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  31.37 
 
 
481 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  32.55 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  32.08 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  31.89 
 
 
495 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  29.24 
 
 
472 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  31.59 
 
 
459 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.42 
 
 
489 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8973  Amidase  30.28 
 
 
502 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257505  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  29.83 
 
 
501 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  29.65 
 
 
472 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  29.17 
 
 
481 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  29.04 
 
 
466 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  29.27 
 
 
497 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  28.89 
 
 
475 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  32.02 
 
 
485 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  31.15 
 
 
474 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  29.84 
 
 
502 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  33.67 
 
 
486 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  28.02 
 
 
485 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0789  Amidase  31.21 
 
 
467 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  32.12 
 
 
495 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  40.59 
 
 
489 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  40.59 
 
 
489 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0666  amidase  30.47 
 
 
466 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341126  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  40.59 
 
 
489 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>