More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6180 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6359  Amidase  87.02 
 
 		 470 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6180  Amidase  100 
 
 		 470 aa  917    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579752  normal  0.528616 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5271  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  65.81 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5337  amidase  64.18 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3309  amidase  55.56 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  41.06 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1304  amidase  40.71 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  38.59 
 
 		 489 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  36.77 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  35.73 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  38.03 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  36.08 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  38.26 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  38.26 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  33.47 
 
 		 488 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  38.88 
 
 		 476 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  32.27 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  34.74 
 
 		 499 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  32.98 
 
 		 476 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  37.26 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  35.33 
 
 		 483 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  33.54 
 
 		 498 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  36.63 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  36.63 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  33.54 
 
 		 481 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  33.88 
 
 		 501 aa  180  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  34.37 
 
 		 474 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  33.13 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.19 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  31.25 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.06 
 
 		 501 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  31.03 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  31.81 
 
 		 531 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  38.65 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.63 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  32.64 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  35.27 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  35.11 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.85 
 
 		 473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  33.89 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  33.26 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  33.46 
 
 		 519 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  34.52 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  30.85 
 
 		 492 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  31.2 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  33.75 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  33.68 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  35.5 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  36.91 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  35.66 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  32.02 
 
 		 480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  33.88 
 
 		 476 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  32.02 
 
 		 480 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  32.02 
 
 		 480 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  34.43 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  34.13 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  36.41 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  32.33 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  34.54 
 
 		 489 aa  163  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  36.03 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  33.54 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  34.11 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  33.75 
 
 		 502 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.44 
 
 		 496 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  35.07 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  34.07 
 
 		 492 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  34.44 
 
 		 517 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  31.59 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.81 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2581  Amidase  36.08 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  35.19 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  34.08 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  34.44 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.23 
 
 		 496 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.23 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.23 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.23 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  30.72 
 
 		 490 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  35.07 
 
 		 506 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  34.02 
 
 		 496 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  29.96 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  31.27 
 
 		 496 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  30.74 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  32.24 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  30.82 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  30.82 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.53 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  33.4 
 
 		 474 aa  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  34.27 
 
 		 492 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  34.88 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  31.8 
 
 		 465 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  35.22 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  35.22 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  35.43 
 
 		 492 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  33.33 
 
 		 503 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  34.87 
 
 		 495 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32.48 
 
 		 495 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  36.98 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  32.48 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  32.43 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>