More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1403 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  98.07 
 
 
467 aa  924    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  100 
 
 
467 aa  941    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  65.86 
 
 
465 aa  580  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  65.86 
 
 
467 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  40.62 
 
 
475 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  41.5 
 
 
477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  39.78 
 
 
476 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  39.87 
 
 
470 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  40.35 
 
 
476 aa  259  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  39.82 
 
 
476 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2207  amidase  41.61 
 
 
476 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  39.13 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  39.69 
 
 
477 aa  243  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  32.47 
 
 
488 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  33.91 
 
 
466 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  36.93 
 
 
493 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  34.63 
 
 
503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.94 
 
 
485 aa  217  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  36.29 
 
 
489 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.61 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3520  amidase  38.6 
 
 
488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.03 
 
 
477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11510  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.88 
 
 
495 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  36.09 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  36.09 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3669  Amidase  39.23 
 
 
480 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.28 
 
 
473 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  34.13 
 
 
519 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  34.91 
 
 
475 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  35.09 
 
 
495 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.95 
 
 
493 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  30.94 
 
 
475 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  33.26 
 
 
481 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  32.44 
 
 
483 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  31.24 
 
 
472 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  34.75 
 
 
501 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  34.95 
 
 
499 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  30.69 
 
 
475 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  34.89 
 
 
493 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  38.22 
 
 
484 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  33.48 
 
 
474 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1278  Amidase  36.95 
 
 
485 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00371719  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  32.76 
 
 
499 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  34.04 
 
 
508 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  39.29 
 
 
490 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  31.15 
 
 
491 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  33.96 
 
 
476 aa  203  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  35.88 
 
 
498 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  30.49 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3117  Amidase  36.07 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2241  Amidase  35.93 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.965161  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3895  amidase  39.55 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537605  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  34.16 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.32 
 
 
479 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  33.74 
 
 
506 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  33.19 
 
 
474 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  30.47 
 
 
494 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  34.16 
 
 
500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0175  amidase  40.86 
 
 
499 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0135  amidase  36.01 
 
 
470 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  32.83 
 
 
476 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  32.96 
 
 
469 aa  199  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  35.86 
 
 
489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  34.47 
 
 
482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  32.63 
 
 
466 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3824  amidase  36.44 
 
 
505 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315125  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  33.33 
 
 
480 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  33.33 
 
 
480 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  33.33 
 
 
480 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.42 
 
 
491 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.34 
 
 
489 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.530602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  31.17 
 
 
477 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3462  amidase  38.04 
 
 
504 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.174169  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3451  amidase  38.04 
 
 
504 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3514  amidase  38.04 
 
 
504 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.84 
 
 
475 aa  192  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  30.63 
 
 
477 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  32.91 
 
 
481 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11289  amidase  36.34 
 
 
462 aa  192  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12389  amidase  37.31 
 
 
484 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.232492  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  31.21 
 
 
534 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  30.04 
 
 
492 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  31.67 
 
 
477 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3358  Amidase  36.18 
 
 
472 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000174583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.83 
 
 
463 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  34.37 
 
 
492 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  34.15 
 
 
488 aa  190  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  30.74 
 
 
473 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  34.5 
 
 
495 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  29.7 
 
 
494 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  29.7 
 
 
494 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  29.7 
 
 
494 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  33.47 
 
 
522 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  32.43 
 
 
472 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.33 
 
 
463 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  32.32 
 
 
474 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  32.91 
 
 
484 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  31.87 
 
 
463 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  33.48 
 
 
450 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  36.59 
 
 
475 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>